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图和表的选择与制作(二)

已有 989 次阅读 2021-11-26 21:45 |个人分类:SCI论文写作技巧|系统分类:论文交流

 

图和表的格式要求

1. 表格要求

科研论文主流的表格形式是三线表,大多数SCI期刊也是如此要求,复杂表格往往是在主体三线表结构的基础上局部修饰而成的。当然,也有个别SCI期刊采用其他的形式,比如Nature系列杂志出版时多用色彩或明暗相间的形式,但这一般是期刊编辑为了提高阅读性在文稿接受后才处理的,投稿时没有明确要求。

2. 插图要求

相对于表格而言,期刊对插图的要求更加复杂和具体,包括格式、分辨率、字体、字号、线条、版式和色彩使用等等。为了提高插图的视觉性和阅读效果,制作插图应力求用最少的篇幅来讲述故事,而且须遵循清楚、准确、简洁的原则。同时,图中的各种信息应清楚、完整,以便读者在不阅读正文的情况下也能够理解图中所表达的内容;图中各要素(术语名称、数据、曲线或首字母缩写词等)的安排要力求使表述的数据或结果一目了然,避免堆积过多的无关细节,从而造成读者理解困难——这是对插图内容的要求,是为自明性

SCI论文插图可以分为三大类,分别是照片、线条图和示意图。投稿前,作者必须按照目标期刊的要求,准备符合要求的图片。不同的期刊对于插图的参数要求可能略有不同,但也有规律可循,总结如下。

(1) 格式及分辨率

通过照片展示结果的插图属于照片,所有显微镜照片(光学、荧光和共聚焦显微镜)、电镜照片、电泳结果照片、免疫组化照片等等,以及这些照片的组合图都属于照片插图(又叫位图),一般用TIFF格式(或高分辨率JEPG格式)保存,投稿时与论文正文部分分别上传。大部分期刊对照片的分辨率要求是:彩图不低于300 dpi;黑白/灰度图不低于600 dpi。当分辨率不足时,通常无法通过技术手段提升图片质量,除非原图的尺寸很大,否则只能重新采集图像。

线条图包括各类采样软件输出的结果,如动作电位图、流式细胞图、红外图、质谱图等,以及通过原始数据、统计分析后制作的线图、饼图、柱状图、散点图和条形图等。这类图片往往通过Origin, GraphPad等软件根据数据自动生成线条图,随后可直接保存为PDF格式,或以高分辨率TIFF图片格式(1200 dpi以上)投稿。很多时候,需要将照片结果和线条图进行组合,这时组合图分辨率应不低于500 dpi;如果是线条图进行组合,分辨率仍不低于1200 dpi。当分辨率不足时,可以通过以上软件,根据原始数据重新作图。

示意图一般通过Adobe Illustrator绘制,简单的也可以通过PPTWord绘制,不论采取哪种方式,结果最好都保存为PDF格式(即矢量图格式,可无限放大),以便后期修改和根据不同杂志的要求制作插图;如保存为TIFF格式,分辨率不应低于500 dpi。分辨率不足时也可以通过重新绘制提升示意图质量。

以上是不同图片类型对应的最低分辨率要求。在条件允许的情况下,分辨率越高越好,但尽量保证单张图片不超过10 M,否则不便于投稿。

(2) 图片尺寸

SCI插图对图片尺寸有固定的要求,结合插图对最低分辨率的要求,可确保图片通过A4纸打印出版后能看得清楚;因此,插图的尺寸是按照A4纸的排版要求来规定的。一般而言,科技论文出版都是双栏排列,如果插图内容较多,需要占据两栏的宽度,这时图片宽度要求是17.8厘米;如果插图只占单栏,图片宽度为8.6厘米;如果是介于二者之间的宽度,即15厘米——这是绝大部分杂志接受的三种图片宽度(包括Nature);不过,对图片的高度则没有明确限制,一般不超过20厘米。

值得注意的是,为了保证图片的内容清晰可读,单栏图片(8.6厘米)最多由两张宽4厘米的小图并排而成(或由一张线条图组成)。所有的插图均应同时满足尺寸和分辨率的硬性要求。

(3) 字体字号

前面已经提到,杂志社对图片设置的要求,是为了保证插图打印出来可以看得清楚,因此图中的文字不能太小,字号最小不能低于7磅,否则人眼将无法分辨打印出来的更小文字。大部分期刊对字体也有要求,一般是Times New RomanArialArial字体线条粗细不变,美观且便于阅读。

同一篇论文的不同插图之间,或同一张插图的不同部分之间,其字体和字号也应该尽量保持统一,不可混用。

(4) 标记要求

恰当的标记可以显著提升图片的自明性,能让读者更容易理解插图的内容或捕捉到图中的关键信息。SCI论文插图的标注要求主要包括:

1) 组合图各部分以字母标记(ABCD/abcd,必要时配以白色或黑色底框);

2) 病理照片用箭头标出病变位置,右下角标注标尺;

3) 病人照片将脸部、眼部或其他隐私部位做模糊(加黑)处理,影像资料(MRI, CT等)将患者个人信息删除或裁掉,保护病人隐私;

4) 组织标本照片包含钢尺或其他参照物,显示标本长度或大小;

5) 显微镜照片标记标尺;

6) 线条图标明图例、横纵坐标、形状符号或填充物代表的具体对象;

7) 标注统计显著性差异,组间对比通过短线连接,标记星号,必要时注明P值;

8) 图表所用线条粗细介于1~1.5磅之间。

以上要求都比较易懂,但有一点值得强调,即添加显微镜图片的标尺。一般而言,标尺都是后期添加或参照原标尺调整的,这要求原图上有固定的标尺可以参考,后期能做的,就是将图片上的标尺调整一致、美观;如果原图没有任何可以参考的标尺(或者同一参数条件下拍摄的所有照片均没有标尺可以参考),则无法添加。添加标尺通过Adobe PhotoshopAdobe Illustrator都可以完成,一般通过Adobe Photoshop添加。

小技巧3.5 颜色模式

部分期刊还会要求作者调整插图的色彩模式,通常为RGBCMYK模式。一般照片默认的RGB模式应用最为广泛,因其可表现的颜色信息与人眼视网膜相当,颜色真实丰富,又称为真彩色;打印照片时一般要求CMYK模式,彩色打印机由于只有四种颜色的墨盒,往往不能表现所有的真彩色,打印过程容易出现色差,所以,部分期刊会要求作者直接提供CMYK模式的插图。通过Adobe Photoshop打开图片,在图像-模式菜单下可轻易转换对应的颜色模式,如需黑白图像,选灰度模式即可。值得一提的是,RGB颜色信息丰富,转化为CMYK可能会损失色彩信息,故原始照片应尽量采用RGB模式保存,必要时再转化成其他颜色模式。现在大部分期刊都接受RGB模式的插图,不要求作者转换。

 

(5) 颜色模式及彩图

根据Adobe Photoshop对于图片颜色模式的定义,主要的颜色模式包括:灰度模式、RGB颜色(真彩色)、CMYK颜色(印刷色)、索引颜色等,其中前三种模式在投稿图片中用得最多(小技巧3.5)。颜色模式很容易通过Adobe Photoshop调整,因此一般投稿时黑白图用灰度模式,彩色图用RGB模式,除非期刊明确要求彩图用CMYK模式,否则不需预先调整(如图3.1所示)。

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3.1 Adobe Photoshop切换图片颜色模式

国外多数杂志发表论文不收版面费(作者主动选择开放获取权限的除外),但一般都会收彩图费(也有不收取任何费用的杂志)。所以,有些图,如简单的线条图,是可以不用彩色的。不过,这也不是绝对的。越来越多的SCI期刊允许作者在印刷版选择以黑白形式出版论文图片,这样就不会涉及到彩图费问题,同时,在Online发表时还是可以彩色形式发表论文图片,这样既便于读者阅读,也能避免彩图费。杂志社收取彩图费,一般按照彩图张数收费,如果图片信息很丰富或其他原因必须要以彩图出版时,也可以通过将图片进行组合的方式,减少彩图张数,达到降低彩图费的目的。

3. 图片组合

在准备SCI论文的时候,我们往往希望将针对同一研究对象,采用不同实验方法获得的结果(比如定性和定量的结果)组合在一起,从而形成更具自明性和说服力的组合图。这样的图片往往由照片图、线条图、散点图等拼接而成。

如果研究者具有良好的科研习惯,每个实验完成后,都将数据图表按照SCI期刊的要求进行过处理,那么准备组合图的时候就会比较简单,只需要将各部分按照展示的逻辑顺序,在Adobe Illustrator中进行组合,必要时调整一下各部分的尺寸,让每张小图保持大小一致,再加上ABCD的标签,并导出为目标杂志要求的图片格式(一般为TIFF)即可。最后,建议通过Adobe Photoshop再次检查组合图的尺寸、分辨率、颜色模式等参数,以便完全符合目标期刊的要求。

更多的时候,需要对原始图片进行更复杂的处理之后才能拼图。比如,我们需要对拼图的各部分素材进行预处理(使其分别符合上述SCI期刊的要求),常见的预处理操作包括:添加或调整图片的标尺(针对荧光显微镜、透射电镜或共聚焦显微镜等照片)、柱状图质量太差需根据统计数据用GraphPad软件重新作图、条带图质量太差需根据原图重新裁切-排版-标记-组合、生存分析曲线需要重新制作和规范导出(软件自动导出图片格式往往质量较差,应该导出为PDF格式)、照片素材局部加黑或模糊处理(保护个人隐私)、重新添加箭头或复杂的文字说明,甚至重新绘制流式结果的横纵坐标轴等等。将预处理好的素材,在Adobe Illustrator中按照预先设想的版式和展示顺序进行排版、对齐、标记,导出为TIFF格式,并通过Adobe Photoshop检查导出图片的相关参数即可。下图为组合图的示例。(图3.2

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3.2 组合图及图片说明示例

Figure 3.2. Effect of cell cycle–related kinase (CCRK) expression on CDK2 phosphorylation. A) Immunoblot analysis of the effect of siCCRK on the levels of phosphorylated CDK2 and total CDK2. U-373 MG cells (upper panels) and U-87 MG cells (lower panels ) were transfected with siCCRK or siLuc, and whole cell lysates were prepared from the cells 72 hours after transfection and subjected to immunoblot analysis with antibodies against CCRK, CDK2 (total CDK2), phosphorylated CDK2 (phospho-CDK2), and β-actin (left panels ). Right panels: Densitometric quantitation of levels of CCRK, phosphorylated CDK2, and total CDK2 in U-373 MG or U-87 MG cells 72 hours after siCCRK transfection. Relative protein expression is expressed as a percentage of the expression in control cells transfected with siLuc. Data are the mean values and upper 95% confidence intervals of three independent transfection experiments. *P =0.002; **P =0.001. B) Immunoblot analysis of CCRK, phosphorylated CDK2, total CDK2, and β-actin (control for equal loading) protein expression in five glioblastoma multiforme cell lines (U-373 MG, U-87 MG, U-118 MG, SW-1088, and U-138). C) Scatter plot analysis of the relative levels of CCRK and phosphorylated CDK2 protein in the five glioblastoma multiforme cell lines as determined by densitometric scanning of three independent immunoblots. For each immunoblot, the levels of CCRK and phosphorylated CDK2 in U-138 MG cells were arbitrarily set to 1. D) Immunoblot analysis of the effect of CCRK overexpression on CDK2 phosphorylation in U-138 MG, U-87 MG, and U-373 MG glioblastoma multiforme cell lines. Each cell line was transfected with either empty pcDNA3.1 expression plasmid (pcDNA) or expression plasmid carrying the full-length CCRK cDNA (pcDNA-CCRK), and protein lysates were harvested 72 hours after transfection. E) Coimmunopreciptation assay. Proteins lysates prepared from U-373 MG or U-87 MG cells were immunoprecipitated with either human immunoglobulin G (IgG) or human CCRK antibody. The immunocomplexes were subsequently eluted, subjected to sodium dodecyl sulfate–polyacrylamide gel electrophoresis, and subjected to immunoblotting with the use of an antibody to CDK2. Immunblotting of β-actin was done in parallel as a control for equal loading.

需要再次说明的是,对图片的编辑和美化的确有助于更完美地展示研究结果,也有助于论文的顺利发表。但图片编辑只限于对图片的参数(分辨率、大小尺寸、颜色模式和对比度等)进行调整,必要时可以在不影响研究结果的情形下,对瑕疵(如血渍、不相关的干扰物等)进行修复,绝对不允许修改任何实验结果,比如篡改数据大小、修改条带图的光密度深浅等等。总之,任何会对结果的解读和分析造成影响或误导的图片修改和操作,都是不可接受的。这些都有学术造假的嫌疑,有可能导致论文因学术不端行为而被期刊撤稿,并对作者的学术生涯产生严重后果。

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