博文
在MRI及microCT三维图像上重建小鼠脑血管
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小鼠用于各式各样的生理，医学实验。了解其解剖结构从而更好地解释实验结果非常重要。因小鼠血管很小，用常规诊断用医学mri, CT 图像仪力不从心。因而需用到高磁场mri及micro CT.
一个加拿大的研究小组(多伦多大学)在这一方面做了很有用的工作 (见文献). 他们用7T mri获得 32
的图像精度, 扫描14小时(!)取到三维图片. 这用来显示脑部软组织. 接着,他们将小鼠脑部从颅骨取下, 用microCT行360度旋转照影, 达20精度. 最后用图像处理软件(Amira)手工分离脑血管组织, 并与脑部软组织整合. 出来的效果很好. 既是小鼠脑生理研究的必要基础, 在感观上也震撼. 于下做一简单点评.
小鼠脑血管结构与人脑结构很相似, 都由两颈动脉(carotid artery, IC), 及两椎动脉(vertebral artery, VA)供血. 下图可见较大的颈动脉.
中间剖分, 见颈动脉的分支, 如脑前动脉(ACA). 同时可见两椎动脉结合形成的基底动脉(BA).
这是基底动脉的分支, 后脑动脉(PCA), 它们与ACA通过Willis环连通.
很酷的视图, 侧下部观脑组织. 见负责脑后部循环的VA, BA. 亦见前部循环的MCA.
美丽的Willis环. 这张图简直可以参加'科学+艺术'图片大赛. 让人惊叹.
纵断面见各大小血管. 半透明的软组织起到很好的渲染效果.
难能可贵这个小组还将静脉也分离, 显示出来. 顶端静脉结构与人极为相似.
我认为, 这个工作, 一要设备, 二要耐心, 三要眼光. 虽然手工重建费时费力, 但准确.
而且, 这是个基础性的脑部组织工作, 必然带来它以后的高引用率.
参考文献：
【1】A. Dorr, J. Sled, and N. Kabani, “Three-dimensional cerebral vasculature of the CBA mouse brain: A magnetic resonance imaging and micro computed tomography study,” NeuroImage, vol. 35, no. 4, pp. 1409-1423, May. 2007.
https://blog.sciencenet.cn/blog-467350-374804.html
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一个加拿大的研究小组(多伦多大学)在这一方面做了很有用的工作 (见文献). 他们用7T mri获得 32
的图像精度, 扫描14小时(!)取到三维图片. 这用来显示脑部软组织. 接着,他们将小鼠脑部从颅骨取下, 用microCT行360度旋转照影, 达20精度. 最后用图像处理软件(Amira)手工分离脑血管组织, 并与脑部软组织整合. 出来的效果很好. 既是小鼠脑生理研究的必要基础, 在感观上也震撼. 于下做一简单点评.小鼠脑血管结构与人脑结构很相似, 都由两颈动脉(carotid artery, IC), 及两椎动脉(vertebral artery, VA)供血. 下图可见较大的颈动脉.
中间剖分, 见颈动脉的分支, 如脑前动脉(ACA). 同时可见两椎动脉结合形成的基底动脉(BA).
这是基底动脉的分支, 后脑动脉(PCA), 它们与ACA通过Willis环连通.
很酷的视图, 侧下部观脑组织. 见负责脑后部循环的VA, BA. 亦见前部循环的MCA.
美丽的Willis环. 这张图简直可以参加'科学+艺术'图片大赛. 让人惊叹.
纵断面见各大小血管. 半透明的软组织起到很好的渲染效果.
难能可贵这个小组还将静脉也分离, 显示出来. 顶端静脉结构与人极为相似.
我认为, 这个工作, 一要设备, 二要耐心, 三要眼光. 虽然手工重建费时费力, 但准确.
而且, 这是个基础性的脑部组织工作, 必然带来它以后的高引用率.
参考文献：
【1】A. Dorr, J. Sled, and N. Kabani, “Three-dimensional cerebral vasculature of the CBA mouse brain: A magnetic resonance imaging and micro computed tomography study,” NeuroImage, vol. 35, no. 4, pp. 1409-1423, May. 2007.
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