书,咖啡分享 http://blog.sciencenet.cn/u/harveyho

博文

细胞内酶反应的简单数学模型

已有 4338 次阅读 2010-10-12 05:50 |个人分类:新知旧识|系统分类:科研笔记| MATLAB, 数学模型

酶(enzyme, E)是一种特殊的蛋白质,它与细胞内特定的目标分子(substrate, S)结合,然后起不可逆转反应生成细胞所需的物质(product, P)。其反应过程如下图所示:



因为两种物质的反应速率与其浓度积成正比(the law of mass reaction), 这个过程可简化为一列微分方程:

设初始条件为:,单位为
系数为:,单位为


解这个线性方程组有几个办法:

(1)用Matlab ode45


(2) 用Newton-Raphson法
 
作两个重要假设:(a) d[E]/dt=0;(b) d[ES]/dt=0, 则上述方程组可简化为Michaelis–Menten方程:



推导过程见【2】。对其积分:



参考文献:

【1】Dunn SM et al, Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2005
【2】Michaelis–Menten kinetics


https://blog.sciencenet.cn/blog-467350-372345.html

上一篇:将微积分方程变代数方程的phasor变换
下一篇:听一个博士生毕业汇报演讲有感
收藏 IP: .*| 热度|

1 杨华磊

发表评论 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-11-22 21:32

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部