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《单条植物线虫DNA微量提取》释疑

已有 6096 次阅读 2008-5-28 18:00 |个人分类:线虫研究|系统分类:科研笔记

自从去年贴出《单条植物线虫DNA微量提取》文章以来,有很多同行来电来信问我该技术方法的一些细节问题,甚至有人提出了质疑,对此我希望可以解释一下。

在我们提出的单条植物线虫DNA微量提取方法中,最关键的一点就是用分子生物学实验室常见的10x PCR缓冲液取代了以前常用的裂解缓冲液(Lysis buffer),这一点非常重要。因为这无疑免去了配制裂解缓冲液带来的麻烦,更何况自配的缓冲液与公司的正规产品在质量上不可同日而语。

其次,由于一条线虫只有1000个细胞左右,所以在提取其DNA时需要比较精巧的手法,将一条大约1mm长的细小线虫在解剖镜下用手术刀切割成2~3段并不是一件非常容易和惬意的事情,这需要细心加耐心再加熟练。

再一个就是实验室所用的试剂问题。毫无疑问,试剂的优劣在很大程度上会决定你实验的成败。在经过多次实验仍然不能成功的情况下,检查一下所用的试剂,或者重新订购一些新的高质量的产品是有必要的,尤其是DNA聚合酶。据实验室的张裕君博士介绍,Takara公司的speed star DNA聚合酶扩增效果不错,货号:DRR070A,可惜我没有试过。

最后要强调的就是你的染色剂的问题。目前实验室常用的染色剂是EB,万万不可想当然的以为实验的成功与否与此无关。当拿到一个PCR扩增产物时,如果你通过EB染色没有发现可见基因条带,那可能有两种可能:第一,扩增失败;第二,扩增成功,但EB染色剂质量不好或浓度不够,这时重新定制或提高EB的浓度很可能会让你有意外的惊喜。

强调一点,我们提出的方法最初在南农线虫实验室研制成功,2003年我把这种方法带到了天津检验检疫局植物检疫实验室,也获得了成功。因此,这种方法的稳定性应该是有保障的,问题应该不会太大。如果可能的话,一方面,我希望国内的同行能来天津交流,另一方面,我会努力在国内其它的实验室对该技术方法进行重现性测试,争取将这项技术再改进,最好能在国内推广,这也是我的最大心愿。

最后,祝愿我的同行们在植物检疫事业上做出卓越的成绩、工作顺利!同时,我真心希望能够与你们保持良好的私人关系!

参考阅读

单条植物线虫DNA微量提取http://www.sciencenet.cn/blog/user_content.aspx?id=9924



https://blog.sciencenet.cn/blog-4636-26954.html

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