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【絮语】
对于基因选择压力的检测,Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)可能是第一反应的分析工具,但PAML的操作令不少初学者望而却步,快速完成基因的选择压力分析,推荐使用一个在线服务器Adaptive Evolution Server。
【关键】
将序列基于密码子比对后,提交序列分析时,先选择一个最适的进化模型,再选择一个压力检测方法。
【网址】
http://www.datamonkey.org/
【说明】
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【结果】
最终生成数据结果,可以根据需要整理不同格式,如《马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析》:
SharmaS, Joshi G, Dash PK, Thomas M, AthmaramTN, et al. (2013) Molecular Epidemiology and Complete Genome Characterizationof H1N1pdm Virus from India. PLoSONE 8(2): e56364. doi:10.1371/journal.pone.0056364
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