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Linux下Gromacs的安装
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该博文是为了那些需要学习Linux下的gromacs但习惯用Windows的用户（Linux初学者）。
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1）在windows系统下安装虚拟机（如VMwareWorkstation-v6.0.0.45731，步骤略）
2）在虚拟机上安装Linux系统，方法步骤见视频（这里以Redhat Linux 4为例，安装需勾选包括gcc等软件的develop tools选项）
3）安装Wmware-Tools
点击虚拟机工具栏中的“VM”中的“Install VMware Tools”，在虚拟机中会出现一个名称为VMware Tools的虚拟光驱。 右键打开终端，将文件夹/media/cdrom/下的所有文件拷到/home/下，依次输入命令：
tar xvzf *.tar.gz （回车）
cd vmware-tools-distrib （回车）
./vmware-install.pl （回车）
一路回车，至此Vmware-Tools安装成功。
4）设置共享文件夹（便于虚拟机与原windows系统进行文件互访）
点击虚拟机工具栏中的“VM”中的“setting”，将Options中的“share folders”改为你打算共享的文件夹（比如该文件名称为“share”）。5）将文件gromacs.tar.gz复制至share文件夹下；进入虚拟机中的Linux系统，将该文件copy至/home文件夹下。
文件gromacs.tar.gz下载地址：http://linxubo.qupan.cc/7060127.html
命令：cd /mnt/hgfs/share
cp gromacs.tar.gz /home
cd /home
tar xvzf gromacs.tar.gz
cd gromacs
chmod +x md_setup.sh
./md_setup.sh
然后漫长的等待。。。
安装结束后，测试是否安装成功。
命令：ls /opt/gromacs/bin
如果该文件夹下有很多文件，则表明gromacs安装成功。
添加路径，方便使用gromacs。
命令：echo $PATH （假设输出结果为“/usr/kerberos/sbin:/usr/kerberos/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/usr/X11R6/bin:/root/bin”）
vi编辑文件/etc/profile，添加“/opt/gromacs/bin”
再输入命令：
PATH="$PATH:/opt/gromacs/bin:."
export PATH
至此，可正常使用gromacs了。
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