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脂肪酸分析tip 1:PLFA 16:0不宜作为细菌的生化标志物

已有 1261 次阅读 2022-8-21 17:24 |系统分类:科研笔记

存在问题:在已发表的文献中,16:0磷脂脂肪酸(PLFA)分子有时也被当作土壤细菌的标志物。这可能是作者未充分研究原始文献导致的误用,如此以往,可能造成越来越多的“误会”,值得专门加以讨论。

我们的观点:含有16:0的生物类群很广(Findlay et al., 1990; Peacock and White, 2016),而且它的含量占总PLFAs的比例往往很高(土壤样品中其含量可>10%,笔者未发表数据),故16:0其实是非常不保守的生物标志物;若将其作为细菌的标志物之一,容易严重高估细菌的生物量及其潜在作用,客观上使真菌细菌比明显下降,不利于反映真实的微生物群落结构特征。

参考文献:

o    Findlay, R. H., Trexler, M. B., Guckert, J. B., & White, D. C. (1990). Laboratory study of disturbance in marine sediments: response of a microbial community. Marine Ecology Progress Series, 62, 121–133.

o    Peacock, A.D., White, D.C. (2016). Microbial Biomass and Community Composition Analysis Using Phospholipid Fatty Acids. In: McGenity, T., Timmis, K., Nogales , B. (eds) Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols. Springer Protocols Handbooks. Springer, Berlin, Heidelberg. https://doi.org/10.1007/8623_2016_213


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