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遗传作图:
QTL定位:
WinQTLcart2.5; QTLmapper; QTLnetwork
基因组拼接:
Phrap; Soapdenovo;mira;velvet;
转录组拼接:
比对软件:
Blast; ABblast; soap; maq; bowtie; bwa
基因结构注释:
Genscan; snap; GlimmerHMM; Augustus; Fgenesh; PASA;
基因功能注释:
重复序列注释:
LTR_FINDER; LTR_STRUC; Piler; Recon; RepeatModeler; RepeatSout; Trf; MISA; RepeatMasker;
非编码RNA注释:
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