本篇包括7个领域，53个问题，分述如下：

生态系统功能和服务

     千年生态系统评估（2005）中，将生态系统服务定义为：人类从生态系统中获取的效益，并强调了生物多样性丧失和生态系统服务退化对全人类福利的影响。如何将生态系统服务的概念应用到实践当中，人们早已有了极大兴趣并开展了大量工作。不管用何种方法，将生态系统服务理论应用到实践中的目的有二：作为生物多样性保护的基本原理；作为一种方法，可用于设计从生态系统可持续管理中获取最大效益的政策方案。在整个研究中，最关键部分包括：对产生生态系统服务的最基本生物多样性组成的调查；量化因生物多样性丧失而引起服务的变化；构建不同区域、不同社会部门生态系统服务的货币和非货币价值评估体系。
1．引起生态系统功能和服务受损的物种多样性丧失或特殊物种丧失的临界值存在吗？如何对这些临界值进行预测？
2．用于评价生态系统服务的不同方式的效力是什么？
3. 如何将生物多样性的认识纳入经济决策，以反映生物多样性、生态系统进程产品和服务的货币与非货币价值？
4. 在极端事件中，如何管理生态系统以提高对人类和生物多样性的保护能力？
5.如何、什么地方、什么时候生物多样性的丧失开始对人类福利产生影响？
6.什么措施在分配从生物多样性保护中得到的物质效益时，有利于环境管理和生物多样性保护的培育？ 
7. 如何将保护区网络设计为既有利于增加碳存储效益又有利于减轻气候变化的影响，并凭借这些效益激发人们对保护行动的支持？
8. 土壤生物多样性对生态系统服务范围和持久性，包括农业生产力是如何作用的？
 

气候变化

     许多陆地、淡水和海域生态系统已遭受到区域温度增加的影响（IPCC 2007）。变化最快的是极地地区，在过去50年中，那里的稳定增加了2-3℃。伴随着降水量的变化，海域生物化学、海平面和极端气候事件等引起了全世界的关注：在气候变化情况下，如何最有效地保护生物多样性。最近，人们对目前无法固定超过前工业时代温室气体的水平给予了更多关注。只这一水平的温室气体，就能使全球温度增加2℃（Anderson & Bows 2008），这导致人们不断要求政府应制定一系列应对温度增加4℃的长远方案。所有的组织水平上，气候变化、应对和减缓措施都直接和间接地对生物多样性产生影响。保护意识、政策和实践所面临的各种挑战根深蒂固。
9. 极地冰川消融和永久冰川的减少将会对人类利用高海拔生态系统产生何种影响，人类利用的改变将如何影响生物多样性？
10.生物多样性的那些要素、那些区位对气候变化最脆弱，包括极端事件？
11. 生态系统弹性在面对因人类行为和干扰而引起的气候变化时，怎么发挥作用的？
12.什么因素决定海域生态系统对海平面上升的响应水平，那些因素易于管理？
13. 气候变化同其它环境压力是如何改变野生物种疾病的分布和广泛传播的？
14.人类将如何对气候变化（如农业变化、资源冲突和移民）作出响应？
15.为了适应气候变化，生物多样性政策和管理实践是如何修正和实施? 
16. 碳交易市场的出现将如何对保护管理和生境创建进而对生物多样性产生影响？
17. 气候变化和生态系统动态之间（如干旱）的反馈将对碳固定和生物多样性保护政策的有效性具有哪些潜在影响？
18. 不同生态系统，包括土壤固碳能力多大，如何管理这些生态系统使它们能最有效地减缓气候变化？
19. 如何、什么地方和何种程度上自然及半自然生态系统对气候变化适应和减缓有贡献？
20. 气候变化是如何影响扰动分布及气候依赖性扰动模式如野火的？
21. 气候变化是如何影响全球粮食生产的，对生态系统和农业生物多样性而言，影响产生的结果是什么？
22. 生物多样性是如何形成应对气候变化影响的社会弹性的？ 

技术变革

     纳米技术、人造生命和机器人技术等的快速发展，可能对保护研究和实践产生一系列全新的挑战（Sutherland et al. 2008）。一个最有可能引起争议的领域是：评估潜在技术手段在减缓和应对环境变化中的综合意义（Sutherland et al. 2008），如曾经对生物燃料的争论（如Koh&Wilcove 2008）、and wind farms (Lucas et al. 2007). Horizon-scanning pproaches(Sutherland and Woodroof 2009) or 景观计划(WCS Futures Group 2007) 等在成为不可控制或不可逆前，尽量减少不可预见性和不良后果出现的可能性，并使丧失机会的可能性减少。尽管目前的农业革新建议关注陆地生态系统，但未来在海域和淡水生态系统中的创新如水藻基因上的改变是有可能发生的。
23. 纳米技术对生物多样性保护有怎样的正面和负面影响？
24.可更新能源的缓解措施类型、位置和捆绑措施如何影响生物多样性？ 
25. 有机体基因水平上的改变将对生物多样性产生何种直接和间接影响？
26. 对新出现的“生物经济”市场（粮食作物用于医药、整形和粘合剂等）的土地利用和生物多样性有什么意义？

保护面积

     陆地面积的12.9%（Chape et al.2008）和海洋面积的0.72%(Spalding et al. 2008)通常作为生物多样性保护的基本目标而被保护起来。一些国际协议，如生物多样性协议、世界遗产协议和国家重要湿地协议等为保护区的合作设计、命名和管理构建了一个全球框架。政府和大量非政府保护机构在国内和国外保护区追加了大量投资。保护区被认为是教育普通大众的一个最好机会。然而，保护区受到多方面的威胁，包括生态旅游的不可持续、资金短缺、外来种入侵、偷猎和人类居住地的扩张（如Sodhi et al. 2008）等。在全球尺度上，似乎保护区的建设速度超过了我们的管理能力。尽管在保护区开展了大量研究，但这些研究对保护实践的影响还非常有限。
27. 不同类型的保护区（如严格的自然保护区、禁猎区和国家公园等）在保护生物多样性和提供生态系统服务方面如何有效？
28. 高效管理每公顷保护区的管理成本是多少？随着保护区类型、地形和威胁的不同，管理成本应作出何种调整？
29.保护区的人类福利成本和效益是什么？它们是如何分布的？如何随管制、资源所有权安排和位置属性变化的？
30. 保护区管理是如何对其它未保护区域的保护产生影响的，例如通过人口安置、狩猎或捕鱼的替代等？

生态系统管理和恢复

     目前，多数世界生物多样性保护存在于保护区之外。在可预见的将来，这一事实恐怕很难被改写。维持这一基本的生态完整是非常重要的，因为它有支持生物多样性和维持保护区生存的内在能力（Hunter 2005）。要在一个景观上同时取得资源保护和资源利用的成就，就必须对生态系统结构和功能有相当的认识，包括历史条件、自然干扰模式及密集型和粗放型资源利用的相对价值。
31.生物多样性和源于集中管理系统的自然资源生产中，应作出何种权衡？例如植树造林和水产业与直接从其它更多自然生态系统中获取这些资源的权衡。
32. 在未受人类明显干扰前，生态系统的状态是什么？如何应用这些知识来改善目前和未来生态系统的管理？
33. 有益于生物多样性和人类福利的大尺度生态系统恢复的机会是什么，在哪里？
34. 如何设计生态系统管理，才能使其尽可能保持自然进程，尤其是自然干扰模式？在何种程度上，保护改善才算有效？
35. 在什么程度、什么条件下，水域、陆地和淡水生态系统的集成管理比单一管理有更好的产出？
36.哪一类人类居住模式（集中与分散）对生物多样性的影响最小 ？
37. 在景观尺度上，为了生物多样性保护，生产产品（如食物、木材或生物燃料）的保护区应该如何分布？
38.如何把对影响家庭在不同自然资源投资—以生产活动为基础（如农业、渔业或狩猎）的因素的理解，应用到预测家庭对环境变化响应过程中给生物多样性保护造成的影响当中？ 

陆地生态系统

     陆地生态系统是多数人生存的地方，并是多数食品、纤维和生物燃料被生产、消费和处置的地方。同时，它们也是具有潜在固定或释放大量碳、氮和污染物的淡水和海洋生态系统的积水区(Gibbs et al. 2007).。陆地利用的多元化（如农业、美学和商业种植）和与之相关的权利由复杂的、多样的文化和法律制度管制。随着人口的增长和土地创新利用的出现，包括碳固定和非食物作物如医药品的发展，加剧了土地利用的竞争，从而提高了人类消费和生产的满意度。因此，需要进一步理解如何实现土地利用的多元化管理。
39.生物燃料生产对生物多样性和生态系统服务的影响是什么？原料类型、位置、目标和技术应用如何改变这些影响？
40. 何种情况下，农业发展能通过减轻自然生态系统压力而有助于全球生物多样性的保护？
41. “生物多样性友好型”农业实践，如有机农业、少耕和农业环境项目对农业报酬和多样性有何影响？
42.在何种情况下，造林和源于森林采伐及退化释放物的减少有益于生物多样性的保护、排放物的减少和可持续生计的供给？
43.不同森林管理模式如何影响生物多样性保护结果和REDD（emissions from deforestation
and degradation）的实施？
44. 多重压力的相互作用，如本地牲畜的放牧、土壤退化和干旱如何影响干旱和半干旱区生态系统？
45. 城市自然保护和其它绿色娱乐空间，如高尔夫球场对生物多样性保护的贡献是什么及如何提高它们的贡献能力？

海洋生态系统

     超过60%的人生活在海岸上，这使海域生态系统压力大大增加(WRI 2005). 通过撒网捕鱼和级联效应，对鱼类种群的数量产生了极大影响 (Norse & Crowder 2005)。面对海产品蛋白质的需求增加，全球捕鱼业停滞不前遭到反驳，这引起了水产业生产的发展(Pauly et al. 2005), 从而引发新一轮的环境问题。气候变化使得多数处于国际管辖范围内的海洋的可持续管理面临更大的挑战。美国关于海洋法的协议虽然为海洋保护和人类行为的管理提供了一个全球性的工作框架，但落实很难。2002年的可持续发展峰会上，制订了要在2010年开始将生态系统方法用于海洋和捕鱼业的管理；2012年开始建立代表性的海域保护网络，包括每类海域生态系统类型中，最少有20-30%的面积实行严格的保护；2015年恢复已废弃的捕捞区。
46. 海洋酸化将如何影响海洋多样性和生态系统功能？采取何种措施以减轻这些影响？
47. 淡水和海洋水产业的发展，将产生哪些生态、社会和经济影响？
48. 应对气候变化和其它压力时，那种管理措施在延长珊瑚礁生命中最有效？
49. 哪些渔业管理措施对减轻捕鱼影响及对非目标物种和生境保护最有效？
50. 有效的海洋保护区域如何与生物、物理和社会因素及与其它保护区域联系的变化而变化？
51. 气候变化对浮游植物和海洋生产力有何影响，这些反馈反过来对气候有何影响？
52.多种压力尤其是捕鱼、污染、海洋温度变化、酸化和疾病之间如何相互作用，从而对海洋生态系统产生影响？
53. 任何一个国家法律管辖范围外的海洋生物多样性保护，那些机制是最有效的？