最近人们才开始认识到微生物组在疾病中的重要性。肠道微生物组发生改变与肥胖症、糖尿病、代谢综合症和炎症性肠病有关，炎症性肠病也与肠道菌群多样性降低有关。华盛顿大学医学院的最新一项研究，这种疾病与病毒多样性升高有关。研究发现，与健康人相比，炎症性肠病患者消化系统中病毒更加多样化，说明病毒可能在这种疾病中起到一定作用。这项研究2015年1月29日发表在《细胞》杂志上。病毒组（virome）是指人体内的病毒及其基因，这项研究首次将病毒组与疾病关联起来。研究人员指出，人们可能忽略了病毒在肥胖症、糖尿病和常见炎症性肠病中起到的作用。

华盛顿大学微生物学教授Herbert W. Virgin认为，应像对待微生物组那样深入研究病毒组。最新发现可能只是冰山一角，炎症性肠病患者存在的病毒DNA，人们大部分不熟悉，属于新发现的病毒。将来还有大量基础工作要做，包括对这些病毒遗传物质测序，研究这些病毒与肠道、肠道菌的相互作用及机制。

Virgin等分别研究了芝加哥、波士顿和英国等地的3组克罗恩病或溃疡性结肠炎患者。将患者粪便病毒DNA与同一地区健康人进行比较。发现炎症性肠病粪便病毒多来属于噬菌体，这些噬菌体能感染细菌，并将遗传物质整合到细菌遗传物质中。

Virgin推测，噬菌体的来源有两种，一是炎症性肠病患者肠道内细菌死亡后释放的噬菌体扩散到其他细菌，也可能是环境中的噬菌体进入肠道，影响了消化系统或微生物组，进而引发疾病。两种机制也可能共同存在。

开发炎症性肠病药物，科学家需要进一步理解肠道微生物组、肠道病毒组与患者基因的相互作用，炎症性肠病可能是人类、细菌和病毒相互作用的结果。研究人员准备利用炎症性肠病动物模型，以明确人类、细菌和病毒基因对这种疾病的推动作用。

个人看法：这一研究核心看法是细菌因为感染了病毒，导致细菌种类下降，导致肠道菌种类下降产生疾病。或者说细菌病导致人类疾病，病毒种类多了会导致疾病，细菌种类多了对健康有利。这从逻辑上似乎有矛盾，病毒种类多了，应该对细菌多样性有好处，怎么会有相反的结果。或者是因为技术原因，可以设想，当细菌的种类下降，某些感染病毒的少数细菌数量异常增加，提高了检测的效率。当细菌类型多，病毒类型也很多时，目前的检测方法不能全部检测出来，表现出病毒类型减少。总之病毒和细菌都应该多样性才有利健康。