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甲烷是一切细胞类型的代谢产物 精选

已有 8692 次阅读 2022-3-11 11:02 |系统分类:海外观察

教科书上说,有些细菌如甲烷古菌能通过酶作用产生甲烷。现在的一项研究提供了证据,证明存在一种非酶促甲烷生产替代模式这种甲烷生成模式可以发生在所有类型的细胞。如果甲烷这种温室气体是一切细胞的代谢产物。生物是温室气体排放的主力,不仅排放二氧化碳,而且排放甲烷。

甲烷主要是由一种叫做产甲烷古菌的微生物在严格的无氧(缺氧)条件下通过酶的方式产生的。在过去的十年中,一些生物,包括某些植物和真菌,也能产生甲烷。然而,作为这种甲烷生产方式的基础机制还不清楚。

恩斯特等人在《自然》发表的论文,揭示了一种由活性氧(ROS)驱动的甲烷生产过程,该过程可能发生在所有生物体内,无论它们是否存在于缺氧环境中。

这个过程不依赖特定的酶,只需要活性氧、游离铁和合适的甲基。

2014年,研究小组描述了一个三步法,通过这个方法,可在实验室非生物系统中不需要酶制造甲烷(CH4)。这个过程需要三个主要因素:过氧化氢(H2O2)自由铁及合适的甲基化合物。

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1Fenton反应过氧化氢和还原铁(Fe2+)之间的反应,产生一种高度活性的活性氧羟基自由基(OH),以及其他副产物。

2•OH与甲基供体之间的相互作用产生甲基自由基(•CH3)

3•CH3与氢自由基氢原子反应生成甲烷。

从这个产生甲烷的过程我们可以看出氢气也能产生的联想,氢原子能给甲烷自由基反应产生甲烷,氢原子当然也应该可以和自己结合成为氢气,且这种过程不需要前面的甲基自由基的准备工作。研究氢气制造的科学工作非常多,细菌合成甲烷同样可以合成氢气,且甲烷合成正是利用氢气,那么氢气的非酶合成过程应该更为方便。我们中学化学实验只需要用还原性金属和氢离子反应就可以

恩斯特推论这种非酶促甲烷的产生过程也可能发生在细胞中(1)

为了证明这一假设,之前报告的实验室反应发生在自然环境条件下,就像在细胞中发现的那样。此外,细胞在正常代谢过程中不断产生和释放活性氧(包括过氧化氢)、多种甲基化合物和游离铁离子。

作者首先在枯草芽孢杆菌中验证了他们的理论,枯草芽孢杆菌在休眠(代谢不活跃)和营养(代谢活跃)两个阶段中循环。故选枯草芽孢杆菌代谢活跃的状态。

在含有甲基供体二甲基亚砜(DMSO)的培养基上的枯草芽孢。他们发现代谢活跃的枯草细胞自发地不断地产生甲烷。相比在休眠细胞中不会产生甲烷。恩斯特和同事们发现,不同细胞可利用DMSO或游离铁的水平可以调节代谢活跃的枯草芽孢杆菌的甲烷生产。

甲烷生成的增加也可能是由于氧化应激的诱导在许多生理和病理条件下,当细胞无法维持正常的氧化还原平衡时,会产生过量ROS

总之,该小组的数据表明,非酶促甲烷生成的关键前提是活跃的新陈代谢这一过程发生在所有生物体内。作者进一步证明了ROS驱动的甲烷生产的普遍性,证明了这一过程也发生在真菌、植物和人类细胞中。利用活性氧生成甲烷可看作是一个自动化制造过程,其中活性氧、游离铁和甲基化合物是主要材料,甲烷是产品。

活性氧是由许多中枢代谢过程产生的,是正常细胞功能的主要信号分子。也许,在高代谢活性的环境下,甲烷生成是细胞降解ROS的一种方式。这非常类似肠道内为消除大量氢气和二氧化碳而合成甲烷的过程,能将大量(75%)压缩气体总量,减少肠道内气压。

多种病理环境下,潜在有毒的ROS长期积累可能会损害DNARNA、蛋白质和脂质等关键分子。

这种生物成因的非酶促甲烷生产框架为医学、地球科学甚至天体生物学等广泛领域的进一步研究开辟了道路。

例如作者的工作可能会对我们理解细胞功能产生重大影响。细胞中过量的甲烷或扩散到整个组织可能表明细胞应激、氧化还原失衡或细胞铁过剩。

研究表明,在细胞氧化还原适应和调节过程中甲烷属于核心信号分子。下一步关键是分析甲烷水平如何波动以及何时波动,以及在健康和疾病中,甲烷分子是如何在细胞和组织中分布的。

另一个诱人的问题是,是否存在尚未发现的甲烷分子传感器和换能器,它们能对细胞内甲烷水平做出反应,从而恢复细胞ROS或铁的水平。能感受气体分压的模式在细胞内并不少见,如氧气的感受系统和一氧化氮的信号调节作用。如果甲烷产生存在广泛性,甲烷产生的生物学效应存在重要性,细胞感受和调节甲烷就存在必要性)

这些分子可能进入哪些已知或未知的途径?研究人员现在已经掌握了在生命的所有领域,在体外和体内生成甲烷的方法。现在应该建立进一步的一系列甲烷研究程序,包括检测ros驱动的甲烷和在细胞和组织中使用甲烷途径

这反过来又可以成为未来工作的另一个激动人心的角度:医学研究。

也许ROS驱动的甲烷生成可以作为ROS水平的标志,就是说甲烷是一种氧化应激标志而通过呼吸分析甲烷水平,过去是分析肠道菌群的一种方法,未来可作为一种身体氧化应激水平的诊断技术。

之前对狗的一项研究发现,通过气体吸入释放的甲烷可以通过减少氧化应激和炎症,减少缺血-再灌注损伤(缺氧后含氧血液重新进入组织时造成的损伤)

这是一个令人鼓舞的迹象表明了解ros驱动的甲烷生物学的潜在价值。

除了生物研究之外,考虑到甲烷是一种温室气体,所有生物都在不断产生甲烷的想法将引起地球和气候科学家的兴趣尽管ros驱动的甲烷是否对全球甲烷排放总量有实质性贡献将是一个挑战。

在我们能够完全理解恩斯特的研究价值和含义之前,还有很多工作要做

该评述作者是西安交通大学张靖垚(zhangjingyao)。

科学网—甲烷:新的生物活性气体 - 孙学军的博文 (sciencenet.cn)

Methane might be made by all living organisms

Ernst, L. , Steinfeld, B. , Barayeu, U.  et al.  Methane formation driven by reactive oxygen species across all living organisms. Nature (2022).  https://doi. org/10. 1038/s41586-022-04511-9 




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