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教科书上说,有些细菌如甲烷古菌能通过酶作用产生甲烷。现在的一项研究提供了证据,证明存在一种非酶促甲烷生产替代模式,这种甲烷生成模式可以发生在所有类型的细胞。如果甲烷这种温室气体是一切细胞的代谢产物。生物是温室气体排放的主力,不仅排放二氧化碳,而且排放甲烷。
甲烷主要是由一种叫做产甲烷古菌的微生物在严格的无氧(缺氧)条件下通过酶的方式产生的。在过去的十年中,一些需氧生物,包括某些植物和真菌,也能产生甲烷。然而,作为这种甲烷生产方式的基础机制还不清楚。
恩斯特等人在《自然》发表的论文,揭示了一种由活性氧(ROS)驱动的甲烷生产过程,该过程可能发生在所有生物体内,无论它们是否存在于缺氧环境中。
这个过程不依赖特定的酶,只需要活性氧、游离铁和合适的甲基。
2014年,该研究小组描述了一个三步法,通过这个方法,可在实验室非生物系统中不需要酶制造甲烷(CH4)。这个过程需要三个主要因素:过氧化氢(H2O2)、自由铁、及合适的甲基化合物。
1、Fenton反应是过氧化氢和还原铁(Fe2+)之间的反应,产生一种高度活性的活性氧羟基自由基(OH),以及其他副产物。
2、•OH与甲基供体之间的相互作用产生甲基自由基(•CH3)。
3,•CH3与氢自由基(氢原子)反应生成甲烷。
(从这个产生甲烷的过程我们可以看出氢气也能产生的联想,氢原子能给甲烷自由基反应产生甲烷,氢原子当然也应该可以和自己结合成为氢气,且这种过程不需要前面的甲基自由基的准备工作。研究氢气制造的科学工作非常多,细菌合成甲烷同样可以合成氢气,且甲烷合成正是利用氢气,那么氢气的非酶合成过程应该更为方便。我们中学化学实验只需要用还原性金属和氢离子反应就可以)
恩斯特等推论,这种非酶促甲烷的产生过程也可能发生在活细胞中(图1)。
为了证明这一假设,之前报告的实验室反应发生在自然环境条件下,就像在细胞中发现的那样。此外,细胞在正常代谢过程中能不断产生和释放活性氧(包括过氧化氢)、多种甲基化合物和游离铁离子。
作者首先在枯草芽孢杆菌中验证了他们的理论,枯草芽孢杆菌可在休眠(代谢不活跃)和营养(代谢活跃)两个阶段中循环。故选枯草芽孢杆菌代谢活跃的状态。
在含有甲基供体二甲基亚砜(DMSO)的培养基上的枯草芽孢。他们发现代谢活跃的枯草细胞自发地不断地产生甲烷。相比在休眠细胞中不会产生甲烷。恩斯特和同事们发现,不同细胞可利用DMSO或游离铁的水平可以调节代谢活跃的枯草芽孢杆菌的甲烷生产。
甲烷生成的增加也可能是由于氧化应激的诱导,在许多生理和病理条件下,当细胞无法维持正常的氧化还原平衡时,会产生过量ROS。
总之,该小组的数据表明,非酶促甲烷生成的关键前提是活跃的新陈代谢,而这一过程发生在所有生物体内。作者进一步证明了ROS驱动的甲烷生产的普遍性,证明了这一过程也发生在真菌、植物和人类细胞中。利用活性氧生成甲烷可看作是一个自动化制造过程,其中活性氧、游离铁和甲基化合物是主要材料,甲烷是产品。
活性氧是由许多中枢代谢过程产生的,是正常细胞功能的主要信号分子。也许,在高代谢活性的环境下,甲烷生成是细胞降解ROS的一种方式。这非常类似肠道内为消除大量氢气和二氧化碳而合成甲烷的过程,能将大量(75%)压缩气体总量,减少肠道内气压。
在多种病理环境下,潜在有毒的ROS长期积累可能会损害DNA、RNA、蛋白质和脂质等关键分子。
这种生物成因的非酶促甲烷生产框架为医学、地球科学甚至天体生物学等广泛领域的进一步研究开辟了道路。
例如作者的工作可能会对我们理解细胞功能产生重大影响。细胞中过量的甲烷或扩散到整个组织可能表明细胞应激、氧化还原失衡或细胞铁过剩。
研究表明,在细胞氧化还原适应和调节过程中甲烷属于核心信号分子。下一步关键是分析甲烷水平如何波动以及何时波动,以及在健康和疾病中,甲烷分子是如何在细胞和组织中分布的。
另一个诱人的问题是,是否存在尚未发现的甲烷分子传感器和换能器,它们能对细胞内甲烷水平做出反应,从而恢复细胞ROS或铁的水平。(能感受气体分压的模式在细胞内并不少见,如氧气的感受系统和一氧化氮的信号调节作用。如果甲烷产生存在广泛性,甲烷产生的生物学效应存在重要性,细胞感受和调节甲烷就存在必要性)
这些分子可能进入哪些已知或未知的途径?研究人员现在已经掌握了在生命的所有领域,在体外和体内生成甲烷的方法。现在应该建立进一步的一系列甲烷研究程序,包括检测ros驱动的甲烷和在细胞和组织中使用甲烷的途径。
这反过来又可以成为未来工作的另一个激动人心的角度:医学研究。
也许ROS驱动的甲烷生成可以作为ROS水平的标志,就是说甲烷是一种氧化应激标志。而通过呼吸分析甲烷水平,过去是分析肠道菌群的一种方法,未来可作为一种身体氧化应激水平的诊断技术。
之前对狗的一项研究发现,通过气体吸入释放的甲烷可以通过减少氧化应激和炎症,减少缺血-再灌注损伤(缺氧后含氧血液重新进入组织时造成的损伤)。
这是一个令人鼓舞的迹象,表明了解ros驱动的甲烷生物学的潜在价值。
除了生物研究之外,考虑到甲烷是一种温室气体,所有生物都在不断产生甲烷的想法将引起地球和气候科学家的兴趣,尽管ros驱动的甲烷是否对全球甲烷排放总量有实质性贡献将是一个挑战。
在我们能够完全理解恩斯特的研究价值和含义之前,还有很多工作要做。
该评述作者是西安交通大学张靖垚(zhangjingyao)。
科学网—甲烷:新的生物活性气体 - 孙学军的博文 (sciencenet.cn)
Methane might be made by all living organisms
Ernst, L. , Steinfeld, B. , Barayeu, U. et al. Methane formation driven by reactive oxygen species across all living organisms. Nature (2022). https://doi. org/10. 1038/s41586-022-04511-9
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