Native-PAGE和SDS-PAGE的比较
3 A# l! ~7 `8 R7 M4 z) L' i 非变性凝胶电泳,也称为天然凝胶电泳,与非变性凝胶电泳最大的区别就在于蛋白在电泳过程中和电泳后都不会变性。最主要的有以下几点:
1. 凝胶的配置中非变性凝胶不能加入SDS,而变性凝胶的有SDS。
2. 电泳载样缓冲液中非变性凝胶的不仅没有SDS,也没有巯基乙醇。
3. 在非变性凝胶中蛋白质的分离取决于它所带的电荷以及分子大小,不像SDS-PAGE电泳中蛋白质分离只与其分子量有关。
0 S" s; P% ~& P: |, Z. S& ?4. 非变性凝胶电泳中,酸性蛋白和碱性蛋白的分离是完全不同的,不像SDS-PAGE中所有蛋白都朝正极泳动。非变性凝胶电泳中碱性蛋白通常是在微酸性环境下进行,蛋白带正电荷,需要将阴极和阳极倒置才可以电泳。
0 o$ p3 K* X" Z- x0 F: R5. 因为是非变性凝胶电泳,所有的电泳时候电流不能太大,以免电泳时产生的热量太多导致蛋白变性,而且步骤都要在0-4度的条件下进行,这样才可以保持蛋白质的活性,也可以降低蛋白质的水解作用。这点跟变性电泳也不一样。
% V8 l2 l( i4 q9 b4 w% Q4 P 所以与SDS-PAGE电泳相比,非变性凝胶大大降低了蛋白质变性发生的机率
Native-PAGE常见问题分析
0 G7 B% e7 k. p; I$ o$ Q. R4 Z
1. 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳时预电泳是怎么回事的?预电泳时要加6×DNA上样缓冲液吗?电泳1-2小时再加结合反应产物吗?
预电泳是除去凝胶中没有聚合的单体和双体和聚合引发剂,提高分辨率,不加任何物质,一般30-60分钟后加样电泳。; c. d6 L& c3 A% a- D" ]. V
2. 银染的步骤是什么?银染的关键因素是什么?
步骤是:
(1) 固定:10%冰乙酸30min。
(2)清洗:双蒸水冲洗凝胶2次,每次1min。1 K" N/ m% Y7 o
(3)染色:染色液(1g硝酸银,1.5mL37%甲醛,1L双蒸水。现配)染色30min。
(4) 清洗:迅速洗凝胶1次。
(5)显影:30g碳酸钠,1.5mL37%甲醛,200uL 10mg/L硫代硫酸钠。显影至清晰带纹出现。
成功银染的关键因素包括:$ S% ]0 ^' D0 d" r0 S* K1 y- z
(1)用超纯水(比如,NANOpure或Milli-Q纯化)或者是双蒸水作银染。2 T- a& G8 e- {8 c: S
(2)用提供的碳酸钠或者ACS试剂级的碳酸钠。! q+ L: w2 H; I5 S
(3)在染色后,水清洗所用时间的长短很重要,用不超过5-10秒的时间清洗胶,然后放入显色溶液中,一般在水里浸一下就好。
(4)甲醛和硫代硫酸钠(400ul/1ml)在使用前,及时加入到显色液中。
(5) 在使用前及时配染色液。/ A# ' x, Y- c* D# O3 K6 R
3. 变性PAGE的上样缓冲液配方?如何准备上样的蛋白?是将细胞用超声破碎,还是用细胞裂解液,大多细胞裂解液中均含有SDS,不知有没有用于非变性PAGE的裂解液.具有操作步骤是什么?3 i5 n2 J* f' o
非变性的PAGE buffer就是0.5xTBE,上样缓冲液可以用普通的loading buffer,含有Tris,溴芬兰以及甘油即可,甘油是主要的沉淀作用成分。都可以自己配。细胞超声即可,超声后离心取上清.也有配NATIVE-PAGE gel所用buffer为1*TBE,用的running buffer也是1*TBE。还有一点就是要在配gel时考虑能使蛋白多聚体稳定的因素。
4. 做了naive---PAGE没有条带,蛋白质是纯品,分子量很大,怎么回事呢?
因为分子量很大,8%的胶浓度较合适。加样时加个marker,可以检测胶制备是否有问题。银染方法比较灵敏,如果蛋白是一种酶,且可使某种底物显色的话,可以用活性染色试试,更灵敏。