著名学者朱维铮质疑孔子后代的真伪。他说：“史书上明明白白记载着孔子的嫡系，到他的二十世孙孔融被曹操灭门，就中断了。孔子说过“夷狄之有君也，不如诸夏之无也”。建立金朝的女真权贵痛恨此说，攻打北宋时到曲阜就放火烧了三孔。当时跟随宋高宗南逃的人群里有孔子的族裔，就是迁居浙江衢州的“南孔”。稍后金朝海陵王突然想到要尊孔，就在民间拉出一个人封作衍圣公，于是“北孔”就续起族谱了。这样的历史在蒙元又重演。有历史记载可证。”（网上可见这篇访谈：朱维铮:不怕得罪孔子200万"后裔"_网易读书）

陈寿《三国志》未给孔融做传，《后汉书》有《孔融传》。“孔融字文举，鲁国人，孔子二十世孙也。”孔融因多次指责曹操，“发辞偏宕，多致乖忤”，曹操“疑其所论建渐广，益惮之。然以融名重天下，外相容忍，而潜怨正议，虑鲠大业。曹操既积嫌忌，而郗虑复构成其罪，遂令丞相军谋祭酒路粹枉状奏融。书奏，下狱弃市。时年五十六。妻、子皆被诛。”