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在一项新的研究中,加利福尼亚大学戴维斯分校的一个科学家小组和美国农业部农业研究服务处(ARS)使用了一种独特的方法,通过利用两种最先进的技术:long-read DNA sequencing和optical genome mapping,对英国胡桃及其北美野生胡桃的基因组进行测序。由此产生的基因组序列被认为是所有木本多年生植物中质量最高的。
“通过对核桃杂交种的基因组进行测序,我们在通常需要产生一个基因组序列的时间内为双亲完整的基因组序列测序”加州大学戴维斯分校植物科学系的首席基因组研究员和研究遗传学家Ming Cheng Luo说。
这种方法可以应用于树木和许多其他木质多年生植物的基因组测序,为更好地理解杏仁、山核桃、开心果和葡萄的遗传蓝图打开了大门。
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190326160527.htm
Journal Reference:
Tingting Zhu, Le Wang, Frank M. You, Juan C. Rodriguez, Karin R. Deal, Limin Chen, Jie Li, Sandeep Chakraborty, Bipin Balan, Cai-Zhong Jiang, Patrick J. Brown, Charles A. Leslie, Mallikarjuna K. Aradhya, Abhaya M. Dandekar, Patrick E. McGuire, Daniel Kluepfel, Jan Dvorak, Ming-Cheng Luo. Sequencing a Juglans regia × J. microcarpa hybrid yields high-quality genome assemblies of parental species. Horticulture Research, 2019; 6 (1) DOI: 10.1038/s41438-019-0139-1
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