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人类的健康受到环境因素和身体与微生物群的相互作用的影响,特别是肠道。基因组序列对于描述单个微生物并理解其功能作用至关重要。然而,先前的研究估计肠道微生物群中只有50%的物种有基因组已测序,部分原因是许多物种还没有被培养来用于研究。
能源部劳伦斯伯克利国家实验室(Department of Energy's (DOE) Lawrence Berkeley National Laboratory (Berkeley Lab), 格莱斯顿研究所(Gladstone Institutes)和Chan Zuckerberg BioHub的研究人员本周在《自然》杂志上发表了近61000个微生物基因组,这些基因组是由3810个公开的人类肠道宏基因组(human gut metagenome)经计算机重建的。这些宏基因组是微生物群样本中的所有遗传物质。宏基因组组装基因组(The metagenome-assembled genomes,MAGs))包括2058个以前未知的物种,从而使已知人类肠道物种的数量达到4558个,并使肠道细菌序列的系统发育多样性增加了50%。
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190315095805.htm
Stephen Nayfach, Zhou Jason Shi, Rekha Seshadri, Katherine S. Pollard, Nikos Kyrpides. Novel insights from uncultivated genomes of the global human gut microbiome. Nature, 2019; DOI: 10.1038/s41586-019-1058-x
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