在郝柏林的文章“二十世纪我国自然科学基础研究的艰辛历程”（科学，55（4）：21-26，2003）中，他认为：我国传统文化中没有现代意义的自然科学基础研究。而且，在自然科学基础研究还没有完全摆脱半殖民地的心理状态，因此，我国工业界没有立足在在自己的坚实的创新成果上。

       文章指出：“中学为体，西学为用”强调的是技术；“科技”一词在实践中主要（甚至于全部）指技术。

       文章还指出：早在1956年，周恩来就提出要改变对于科学基础的理论研究的忽视。文章认为，到目前为止，这一局面没有该变。

       作者认为，“把竞争机制引入基础研究”其实表明没有做真正的基础研究。真正的基础研究无“国内首创”之说。如果按照基金委的申请书中的“立论依据”、“研究方案”开展研究，就注定不可能有原始创新。

       该文的确是没有多少人喜欢看的。火药味很浓。

       但是，我认为，该文的确是论说有力的。

       我认为，目前，“在自然科学基础研究还没有完全摆脱半殖民地的心理状态”的主要表现形式是科研论证的方式。不是以科学自身内在的思想和逻辑性来论证，而主要是通过引用国外的“牛”的论文中的话来论证。目前的论文数数法及配套的所谓指标只不过是登峰造极而已。

       在过去的很长时间里，我并没有认识到：“在自然科学基础研究还没有完全摆脱半殖民地的心理状态”这一概念，对论文没能发表在我国“公认”的国际“名刊”上而感到“羞涩”。我长期的不清楚这是什么心理在作怪，在看了郝的文章后，算是有了一个本质的认识。

       只不过是在近几年，当我把阅读和研究的视角放在全球性背景上以后，才认识到什么是独立自主的基础科学研究工作（它的特征可概括为：以科学自身内在的思想和逻辑性来论证；以实践证明为判决准绳），也才在心理上摆脱了对西方学界的仆从心理，而把自身的研究结果看成是同等重要的研究。这一步很难，难在以理性上的洞察为基础，难在以理性的思考来重新审视基础科学的学术体系。

       最近半年来的中东事变给人感触很深，西方对我国也一直使用双重标准。在科学领域，我很早（1980-1990S年代）就领教了。

       我认为，在今后的几十年里，我们必须在基础科学研究中走独立自主的路线，而不是以“半殖民地的心理状态”在别人的只言片语中去寻求所谓的灵感，也拒绝在不平等基础上的（被视为：仆从者）所谓“评价”。

       “半殖民地的心理状态”是学术自信心不足的根本原因之一，要在理性深层上摆脱它有慢长的道路要走。而在感情上摆脱它，喊叫几句口号就可以了。

       感情上摆脱“半殖民地的心理状态”的办法是：把西方的基础科学理论全盘推翻或否定，但也就到此为止。

       而在理性上摆脱“半殖民地的心理状态”的办法是：对西方的基础科学理论进行深入的学习和研究，在此基础上，独立自主的进行开拓。从而，吸收和消化它，并发展它。

       这就需要有学术上的自信心。而这种学术上的自信心的获得决非是短期行为可以获取的。