小麦是我国三大粮食作物之一，其产量对保障我国粮食安全和农业可持续发展具有重大现实和战略意义。当前由于全球气候变化加剧和耕地面积减少，对小麦稳产和增产构成严重威胁。因此，对小麦产量相关性状的遗传结构进行解析，进而通过分子育种手段提高小麦产量和育种效率已经成为当下十分重要的任务。分子整合连锁图谱是进行基因挖掘、数量性状遗传解析和分子育种的重要基础，同时也是进行比较基因组学、DNA序列组装和图位克隆的重要工具。

近期，北京市农林科学院小麦分子指纹鉴定技术研究团队完成的题为“Consensus linkage map construction and QTL mapping for eight yield-related traits in wheat using BAAFS 90K SNP array” 的综述在Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文)，JIA) 2024年11期正式发表。

该研究利用团队自主研发小麦90K SNP芯片（BAAFS Wheat 90K SNP array）对2个小麦双亲衍生群体进行基因分型，构建了一张小麦高密度SNP整合连锁图谱，并结合产量相关性状表型，定位到32个与产量相关的稳定QTL。整合连锁图谱总长为5437.92 cM，共包括44,503个SNP标记，平均8.13个SNP标记/cM。

分析结果表明，整合图谱中标记的遗传顺序和物理位置在全基因组水平上具有较高的共线性。通过对8个产量相关性状（株高、有效分蘖、穗长、小穗数、穗粒数、粒长、粒宽和千粒重）的遗传解析，定位到32个稳定的QTL。其中，4个QTL，即QPH.baafs-4B，QKNS.baafs-4B，QTGW.baafs-4B和QSL.baafs-5A.3，能在多个群体和环境中被重复检测到。9个稳定的QTL，qKL.baafs-1D，QPH.baafs-2B，QKNS.baafs-3D，QSL.baafs-3D，QKW.baafs-4B，QPH.baafs-5D，QPH.baafs-6A.1，QSL.baafs-6A和QSL.baafs-6D，在前人的研究中没有被报道过。同时本研究鉴定到3个重要的产量相关QTL富集区。其中4B染色体上的17.25~44.91M与6个产量相关性状（株高、穗长、有效穗数、小穗数、穗粒数和千粒重）显著相关，是影响产量性状的重要区段。

基于参考基因组IWGSC RefSeq v2.1和expVIP (http://www.wheat-expression.com)数据库中的基因表达数据，本研究筛选到254个较具有潜力的候选基因。这些候选基因主要与植物激素(生长素、脱落酸、细胞分裂素、乙烯和赤霉素等)、碳水化合物合成途径(UDP-糖基转移酶、蔗糖磷酸合酶和蔗糖合酶等)、光系统I或II中心蛋白、E3泛素蛋白连接酶、锌指蛋白、F-box家族蛋白、谷氨酰胺合成酶和转录因子(NAC、MYB、AP2、WRKY)相关。其中候选基因TraesCS5A03G1264300，TraesCS1B03G0624000和TraesCS6A03G0697000特别值得关注，因为它们的同源基因已被证实能调控相应的性状。

该研究构建的整合连锁图谱和鉴定到的稳定产量相关性状QTL及其候选基因将有益于小麦产量相关性状的遗传解析，并有助于加快培育兼具理想株型形态和高产的小麦新品种。

北京市农林科学院小麦分子指纹鉴定技术研究团队庞斌双研究员、张胜全研究员和赵昌平研究员为该文章的通讯作者，刘丽华副研究员和屈平平助理研究员为该文章第一作者。

该研究得到了农业生物育种重大项目（2022ZD0401902）和北京市农林科学院创新能力建设专项（KJCX20230301和KJCX20230307）的资助。

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‍https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095311923002514‍

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