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JIA3期封面文章 | 河南科技大学郭大龙团队揭示细胞壁降解酶基因可变剪接事件在葡萄采后软化进程中重要作用

已有 388 次阅读 2024-10-29 16:23 |个人分类:论文|系统分类:论文交流

‘巨峰’葡萄 (Vitis vinifera L.× Vitis labrusca L.) (‘Kyoho’) 是我国主栽品种,其果粒硕大,果色鲜艳,果实柔软多汁、酸甜可口,是鲜食葡萄中的佳品。果实硬度是衡量鲜食葡萄贮运性的重要指标,‘巨峰’在采后贮藏过程中易发生软化等品质劣变,严重影响果实口感及耐贮性,导致其货架期缩短,商品价值降低。因此,探究采后软化调控机制是延缓采后品质劣变的重要手段,对提升果实品质、延长货架期具有重要意义。目前,葡萄果实采后软化分子机制尚不完全清楚。

近期,河南科技大学郭大龙教授团队完成的题为“Alternative splicing of PECTINESTERASE gene encoding the cell wall-degrading enzyme affects postharvest softening in grape的研究Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文),JIA) 2024年3期发表。 

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该研究对采后‘巨峰’葡萄进行叶酸(Folic Acid,FA)处理(以水处理为对照,CK),通过比较各处理组间果实的转录组数据,筛选出差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),并鉴定采后软化相关可变剪接(Alternative splicing,AS)事件及相关差异表达基因。共鉴定出2559个差异表达基因,根据表达模式将其分为四个亚簇,其中亚簇4中的差异表达基因在CK组中高表达。FA和CK处理组果实中特异性AS相关基因数分别为1045个和1042个,这些基因与细胞壁代谢密切相关。

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通过比较AS相关基因与亚簇4的差异表达基因,筛选出了8个发生AS事件的DEGs,其中包括一个编码细胞壁降解酶的基因(果胶酯酶2、VvPE2、Vitvi15g00704),分析结果显示该基因可能发生了A3SS事件。

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RT-PCR进一步证实在FA处理组的葡萄果实中存在较高比例的VvPE2的截短转录本变体。

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河南科技大学园艺与植物保护学院刘海楠裴茂松为论文的共同第一作者,新西兰皇家植物与食品研究科学院Charles Ampomah-Dwamena为合作作者,郭大龙教授为通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金(32202560和32302470)、河南省高校科技创新团队支持计划(21IRTSTHN021)、河南省自然科学基金(232300421112)和河南科技大学博士科研启动基金(13480068和13480067)等项目的资助。

点击链接查看全文:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S20953119‍23004203

Cite the article:Hainan Liu, Maosong Pei, Charles Ampomah-Dwamena, Yaxin Shang, Yihe Yu, Tonglu Wei, Qiaofang Shi, Dalong Guo. 2024. Alternative splicing of the PECTINESTERASE gene encoding a cell wall-degrading enzyme affects postharvest softening in grape . Journal of Integrative Agriculture, 23(03): 863-875.

Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA由中华人民共和国农业农村部主管,中国农业科学院与中国农学会主办,中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊,月刊。创刊于2002年,现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.8,位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中国科学院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持



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