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JIA专题|棉花生物技术育种—西南大学农学与生物科技学院棉花分子育种团队张正圣教授课题组棉花衣分QTL精细定位的研究

已有 327 次阅读 2024-10-21 10:35 |个人分类:论文|系统分类:论文交流

棉花是世界上重要的纤维作物。提高棉花纤维产量是棉花育种的目标之一。棉花纤维产量是数量性状,由微效多基因控制且容易受环境影响。毛棉在四倍体棉花中与陆地棉亲缘关系最近。两者之间丰富的变异位点是棉花遗传改良的重要遗传资源。鉴定与纤维产量相关的有利等位基因对于提高栽培棉花产量的品种具有重要的意义。

近期,西南大学农学与生物科技学院棉花分子育种团队张正圣教授课题组完成的题为“Map-based cloning of qLPA01.1, a favorable allele from Gossypium tomentosum chromosome segment line” 的研究在Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文)JIA) 2024年10期正式发表。

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项目组前期利用毛棉染色体单片段替换系群体在A01染色体上鉴定到一个控制衣分的稳定QTL(qLPA01.1)。本研究通过对该QTL进行精细定位,结合转录组数据和序列分析结果筛选到其候选基因GoPAT24。为分子标记辅助选择和纤维发育的深入研究奠定基础。

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为精细定位衣分QTL(qLPA01.1),本研究选择在QTL区域为毛棉片段,其它区域为CCRI35的替换系HT_390与CCRI35进行杂交创建次级精细定位群体。我们在QTL区域构建了一张包含47个位点、全长56.98 cM的高密度遗传图谱,通过QTL定位及替换作图最终将qLPA01.1区间缩小到A01染色体约80kb的区域内。该区间包含6个注释基因。随后结合转录组数据及比对克隆结果,初步确定S-acyltransferase protein 24 (GoPAT24) 为qLPA01.1的目标基因。

西南大学农学与生物科技学院棉花分子育种团队张正圣教授为该文章的通讯作者,在站博士后王文文已毕业硕士生陈磊为该文章共同第一作者。该研究获得国家自然科学基金(32172064 、 32201827)的资助。

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‍https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095311924000571‍

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