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R语言在生态环境领域中技术的应用

已有 221 次阅读 2024-11-21 09:02 |个人分类:生态学|系统分类:科研笔记

前言

R语言作为新兴的统计软件,以开源、自由、免费等特点风靡全球。生态环境领域研究内容广泛,数据常多样而复杂。利用R语言进行多元统计分析,从复杂的现象中发现规律、探索机制正是R的优势。

一:R语言基本操作及语法

1R的获取和安装

2R的数据类型

3R的函数

4R包的载入及使用

探索性数据分析

一:不同物种的多度分析

二:不同物种在样方中的空间分布

三:水文、地形等环境数据地图

相关性分析

1、不同变量之间的相关性分析

2、不同物种之间的差异及距离矩阵

3、图解关联矩阵

四:回归分析

1、用lm()拟合回归模型

2、一元及多元线性回归

3、多项式回归

4、回归诊断

5、选择最佳的回归模型

生物量对各因素的回归诊断图

五:聚类分析

样方之间的不同类型聚类及比较(单连接、完全连接、平均聚合聚类(UPGMA)Ward最小方差聚类等)

两种聚类树及其比较

六:排序分析

1主成分分析(PCA)

2、对应分析(CA)

3、主坐标分析(PCoA)

4、非度量多维尺度分析(NMDS)

数据空间分析

1、空间结构和空间分析概述

2、多元趋势面分析

3、基于特征根的空间变量和空间建模

4、多尺度排序(MSO

生物多样性分析

1、生物群落的稀疏度分析

2、生物群落的alphabetagamma多样性

3、群落功能多样性、功能组成和谱系多样性

原文:R语言在生态环境领域中技术的应用



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