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根瘤菌分子系统学研究者应掌握的知识

已有 4615 次阅读 2008-1-6 20:09 |个人分类:根瘤菌进化、发育与系统学

根瘤菌分子系统学研究者应掌握的知识:

 

一、必须熟练掌握使用以下分析软件:

1、  DNAMAN

2、  ClustalX

       Clustal X 用来对核酸与蛋白序列进行多序列比较(multiple sequence alignment)的软件。多序列比较在分子生物学中是一个基本方法,用来发现特征序列,进行蛋白分类,证明序列间的同源性,帮助预测新序列二级结构与三级结构,确定PCR引物,以及在分子进化分析方面均有很大帮助,Clustal X很适合这些方面的要求。

3、  Mega

4、  Sequin

    能向GenBankEMBLDDBJ三大核酸序列库递交序列。可以不用仔细考虑各数据库文件的具体格式,以问答填表格的形式,将需递交的序列和相关资料填好。可以在线直接发送,也可以生成相应格式文件,以e-mail形式发送。

5、  SPSS

6、  GelCompar II

7、  PrimerOligo

8、  NCBI上进行在线blast分析

 

 

二、应知道在这里查找文献:

1、  Google

2、  Baidu

3、  中国知网

4、  农大的西文全文电子期刊导航

5、  NCBI上的PubMed

6、  IJSEM

 

 

三、应知道在这里查找目前根瘤菌某个属共有多少种:

1http://www.bacterio.cict.fr/

    (如访问这里:http://www.bacterio.cict.fr/m/mesorhizobium.html,可知目前中慢生根瘤菌属共12个种。截止到200816日)

 

未完待续……

(如果您看了上面这些内容,觉得还应该掌握某方面知识,请在下面跟贴)

 

 

 



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