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[转载]每日科研进展 l 2023.05.12 l WGCNA分析:未来发现害虫防治RNAi靶标的方法

已有 983 次阅读 2023-5-12 17:06 |系统分类:科研笔记|文章来源:转载

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WGCNA分析:未来发现害虫防治RNAi靶标的新方法

二化螟(Chilo suppressalis)是全世界水稻的一个主要害虫。靶向重要基因的双链RNA(dsRNA)可以在昆虫害虫中触发致命的RNA干扰(RNAi)反应,从而达到害虫防控的目的。

在这项研究中,通过对基于饲喂不同食物的昆虫的RNA-Seq数据的WGCNA分析,发现潜在的能够应用于害虫防治的新型靶标基因。

数据分析结果显示,Nieman-Pick type c 1 homolog b (NPC1b)是与血淋巴胆固醇水平和幼虫大小具有最高相关值的基因。


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图 1. 不同饮食处理中的幼虫长度和胆固醇浓度

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图 2. 与体重相关的基因WGCNA分析

通过RNAi实验验证,抑制该基因的表达,二化螟死亡率提高,生长受阻,支持该基因与胆固醇的吸收和昆虫的生长密切相关。

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图 3. CsNPC1b基因功能验证分析

这项研究揭示了NPC1b在鳞翅目昆虫肠道胆固醇吸收中的关键作用,并强调了WGCNA方法在识别新的害虫RNAi靶标基因中的应用潜力。




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