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[转载]每日科研进展 l 2022.10. 16 l 利用比较转录组揭示 Spdsx 影响青蟹卵巢发育的调节机制

已有 1327 次阅读 2022-10-17 11:06 |系统分类:科研笔记|文章来源:转载

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利用比较转录组揭示 Spdsx 影响青蟹卵巢发育的调节机制

在之前的研究中报道了 Spdsx 在 Scylla paramamosain 的睾丸、雄激素腺和卵巢中的鉴定、组织分布和作用。这项研究中，通过 RNAi 和 RNA-Seq 技术鉴定了 Spdsx 在S.paramamosain卵巢中的潜在靶基因。通过比较两组（注射EGFP和Dsx基因dsRNA的卵巢）转录组数据（图 1），发现6520个Unigenes存在差异表达，其中包括大量参与卵巢发育的保守关键基因，如卵黄原蛋白（vtg）、vtg受体(vtgR)、载脂蛋白 D、腺苷酸环化酶 3、腺苷酸环化酶 5、细胞周期蛋白 A、细胞周期蛋白 B 和细胞分裂周期 2 (cdc2)（图 2）。

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图 1. 卵巢中沉默 Spdsx 后的基因表达水平

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图 2. dsRNA 处理后比较转录组
此外，这些DEGs还富含与卵巢发育相关的通路，包括PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、Wnt信号通路、松弛素信号通路、雌激素信号通路、孕酮介导的卵母细胞成熟、卵巢类固醇生成，和卵母细胞减数分裂。此外，选择了几个基因进行 qRT-PCR 以验证生物信息学结果的准确性（图 3）。

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图 3.  qRT-PCR 验证
根据转录组结果，推测 Spdsx 是 S. paramamosain 卵巢发育的关键调节因子。这项研究是第一次通过甲壳类动物的比较转录组分析dsx的功能，确定了参与S. paramamosain卵巢发育的相关基因和途径，并阐明了其调控机制。
原文链接：
https://doi.org/10.1007/s10126-022-10165-5
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