2018年XX国基评审意见，供参考

<1>该项目旨在研究多种癌症和多尺度基因组学数据的数据融合和挖掘算法，从而预测与癌症相关的功能模块。该项目具有一定的创新思维和较好的科学意义。项目申请人在该研究领域已发表或参与发表论文8篇，其中第一作者5篇，可以视为该项目的前期工作。该项目在之前研究的基础上，提出了新的研究内容。主要包括设计基因表达数据和基因结构数据的信息挖掘和整合算法；针对多种癌症的基因表达和基因结构信息整合算法；从多种癌症的基因表达数据中挖掘癌症特有和共有的功能模块算法。该研究方案中所提出的相关计算方法，可以有效处理高维度基因组学数据并提取其中重要的结构特征。项目的创新点是从问题的模型出发，构建与问题相适应的数学模型及算法。该项目的特点在于已经有初步的模型和算法，并且针对要解决的问题，设计了拟提出的改进后的模型和算法，目的明确，内容详细，可行性较强。但是，对于算法所得结果的可解释性，以及生物学意义没有太多明确说明。尤其是一些与癌症表型有关的重要基因集合以及基因间潜在联系应给予一定生物学层面的考虑。最好能结合相关生物学文献报道，或者是生物学实验给予一定程度验证，以证实其准确性。

申请人在XXX领域，尤其是癌症基因组学方面有一些前期研究的成果和经验。具备完成该项目的基础项目预算合理，建议优先资助。

<2>项目拟通过基因表达数据、基因先验结构信息和miRNA表达数据建立相关模型探索癌症相关功能模块。项目对于理解癌症疾病的发病机制和发现其分子标志物具有重要意义；项目具有一定的创新性；项目分别单独以 miRNA与基因表达数据、基因表达和基因网络结构信息探索癌症特有、共有的模块。建议可以整合miRNA、基因网络和基因表达三种资源探索癌症特有、共有的模块；研究方案可行；申请人具有较好的前期基础，在IEEE系列刊物上发表了多篇学术研究论文。故建议资助。

<3>该项目拟研究面向癌症的结构稀疏化方法研究。该项目对研究癌症具有重要的意义。该项目将研究面向基因表达数据和基因先验结构信息、面向多种癌症的基因表达和基因先验结构信息和面向多种癌症的微小RNA与基因表达的数据。这些研究内容具有较好的创新性。项目的研究方案详细可行。研究团队人员组成合理，前期相关研究基础较好。建议优先资助。