小鼠、狗和人的全基因组测序都早已完成，结果显示，从进化上的亲缘关系来讲，人类最好的朋友不应当是狗，而应当是小鼠。

下图显示根据基因序列资料归纳的几类常见的哺乳动物与人的亲缘关系：

由图中可见，人类与狗和鼠（以及其他常见哺乳动物）在9500万年前都有共同的祖先。这些哺乳动物从9500万年前开始分化为两个进化分支，但人类和小鼠此后仍属于其中的同一个分支，而狗则属于另一个分支。

人类与小鼠在9000万年前还有共同的祖先，从9000万年前开始，才再分化为两个新的进化分支。

人与鼠的基因相似性也比人与狗的相似性要高。

约80%的小鼠蛋白质在人类基因组中具有严格的1：1种间同源体，其序列同一性通常介于70%－100%。

一个典型的例子是小鼠具有大约1200个与嗅觉受体相关的功能基因，为人类相应基因的三倍，但狗的相应基因的数目还要高数倍。所以小鼠在嗅觉敏感性方面仅稍高于人类，却远逊于狗。　

从图中还可看出，猩猩是人类的近亲，鼠、兔与人类的关系稍远，而狗、猫以及猪马牛羊则是人类的远亲。