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狂犬病毒的进化
——大型学术专著《狂犬病》最新版新增的一章
目前国际上关于狂犬病最权威最全面的大型学术专著《狂犬病的科学基础和管控(RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT)》,简称《狂犬病(Rabies)》。该书被誉为有关狂犬病的百科全书。该书初版于2002年,第2版和第3版分别出版于2007年和2013年。其最新版(第4版)于2020年5月出版,共有22章,732页。与前一版相比,最新版新增了两章,体现了近十年来狂犬病研究领域的重要进展。原书内容丰富,本博客在过去三年多的时间里曾陆续对此书的部分内容进行过译介。今天开始译介此书较旧版新增的两章之一:第3章-狂犬病毒的进化。
本章目录(附相应章节中文译文的链接):
3.1 概述
狂犬病毒的进化 (1) 2023-12-17
3.2 狂犬病毒在稳定的宿主-病毒关联中的微观进化动力学
狂犬病毒的进化(2) 2023-12-19
狂犬病毒的进化(3) 2023-12-21
3.3 狂犬病毒的宏观进化动力学
狂犬病毒的进化(4) 2023-12-22
狂犬病毒的进化(5) 2023-12-24
狂犬病毒的进化(6) 2023-12-27
狂犬病毒的进化(7) 2023-12-28
3.4 适应性进化在跨物种传播中的作用:调和(Reconciling)毒株提供的证据
狂犬病毒的进化(8) 2023-12-31
狂犬病毒的进化(9) 2024-01-02
狂犬病毒的进化(12) 2024-01-08
3.5 进化数据在狂犬病预防和控制中的应用——遗传学作为传播的标签
狂犬病毒的进化(10) 2024-01-03
3.6 结论
狂犬病毒的进化(11) 2024-01-05
第3章-狂犬病毒的进化(12)
3.4 适应性进化在跨物种传播中的作用:调和(Reconciling)毒株提供的证据(3)
(Reconciling strains of evidence for the role of adaptive evolution in cross-species transmission )
从这里引用的感染实验中可以清楚地看出,病毒异源转移到新宿主可能导致疾病和宿主在传播发生之前死亡。一般来说,RABV的潜伏期较长与病毒传播更广泛和唾液腺滴度更高有关(Baer & Bales, 1967; Fekadu, Shaddock, & Baer, 1982)。相反,较短的潜伏期往往会导致病毒滴度降低,甚至在病毒到达唾液腺之前就导致宿主死亡(Baer & Bales, 1967; Fekadu et al., 1982; Sikes, 1962)。这表明,该病毒面临着有效和快速复制与延长感染期以最大限度地扩大传播机会之间的权衡。这种毒力与传播的权衡在传染病文献中受到了广泛关注(Ewald, 1983;Galvani, 2003),预计即使在病毒能够在新宿主中持续传播之后,仍会存在对最佳复制和毒力(即宿主死亡时间)的持续选择。事实上,影响宿主种群的生态条件的时间或空间变化,如密度和接触率的波动,可能继续改变这方面的选择压力。与这一假设相一致,Aubert等(1991)发现,与十年后从同一种群中收集的分离物相比,在爆发早期采集的红狐中的一个RABV分离物在实验感染中造成的传播间隔时间长度变化更大。在RABV分离株中驱动这种表型变异的机制,以及它们的遗传决定因素,尚不清楚。
尽管大多数关于RABV适应的进化基础和表型后果的研究都集中在非同义替换上,但要完全解决RABV如何适应新宿主物种,可能还需要考虑不太典型的病毒适应形式。例如,同义取代越来越多地被认为可以调节翻译并影响mRNA的稳定性和二级结构,从而为其参与适应性进化奠定了功能基础(Cuevas, Domingo-Calap, & Sanjua´n, 2012; Novella, Za ´rate, Metzgar, & Ebendick-Corpus, 2004)。一种相关的可能性是,适应可能涉及二核苷酸、密码子或密码子对(codon-pair)在全基因组的使用中产生的同义改变;这种模式与动物储存宿主和节肢动物媒介广泛相关,而节肢动物又与多种多样的RNA病毒相关(Babayan, Orton, & Streicker, 2018; Coleman et al., 2008; Martı ´nez, Jordan-Paiz, Franco, & Nevot, 2016; Plotkin & Kudla, 2011; Shen et al., 2015)。在新宿主中调节复制速率的同义突变可能有利于RABV在宿主明显发病和死亡之前到达唾液腺,从而使其能够传播到新宿主。最后,在自然发生的狂犬病暴露中,病毒和宿主来源成分的多样性几乎完全被忽视了。在流感病毒中,嵌入病毒包膜的宿主蛋白对病毒复制有显著影响(Hutchinson et al., 2014);尽管在RABV中,这种效应预计只能影响暴露期间最早的事件。
(本章全文完)
相关链接:
Anthony R. Fooks & Alan C. Jackson主编,《RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT(狂犬病的科学基础和管控)》,简称《狂犬病(Rabies)》。该书最新版(第4版)共有22章,732页,由Elsevier Inc.旗下的学术出版社(Academic Press)出版。
Rabies - 4th Edition (elsevier.com)Rabies | ScienceDirect
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