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蝙蝠中的人兽共患病和病毒基因组的多样性（10）
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蝙蝠中的人兽共患病和病毒基因组的多样性(10)
五）蝙蝠病毒基因组的挑战
前记：蝙蝠可能是多种人兽共患病的来源，但蝙蝠也是地球生态系统中不可或缺的重要组成部分，而且蝙蝠是目前处于濒危状态需要重点保护的物种。应正确认识新冠病毒、狂犬病毒和其他多种病毒与蝙蝠的关系，应在科学认识和有效控制病毒性传染病的同时，进一步加强对蝙蝠的保护。蝙蝠现在比以往任何时候都更需要我们的保护。
本文通讯作者Edward C Holmes 是国际著名进化生物学家和病毒学家，澳大利亚科学院院士，悉尼大学研究员和教授 ，也是上海复旦大学的荣誉客座教授。本文发表在本月最新出版的国际专业杂志《Current Opinion in Virology（病毒学时论）》上。本博客将陆续摘要译介此文的内容。
本文的目录：
一）引言
二）蝙蝠的病毒基因组的多样性
三）与蝙蝠有关的值得注意的人兽共患病的暴发
1）冠状病毒科（Coronaviridae）
2）副粘病毒科（Paramyxoviridae）
3）弹状病毒科（Rhabdoviridae）
四）为什么蝙蝠能成为众多病毒的储存宿主?
五）蝙蝠病毒基因组的挑战
六）结论——蝙蝠的未来尚难以预测
五）蝙蝠病毒基因组的挑战
mNGS（宏基因组学下一代测序）的广泛应用，导致在蝙蝠中发现了大量新的和高度多样化的RNA和DNA病毒,极大地扩展了我们对已知的病毒圈（virosphere）的知识，并提供了关于特定病毒起源的重要信息。mNGS的优点是多种多样的：该方法可获得明晰的可交叉验证的结果，易于推广应用，具有高灵敏度同时成本持续降低。
然而，分析mNGS产生的丰富序列数据对计算技术的挑战可能相当大，特别是在资源匮乏的条件下，要从蝙蝠体内海量的食物和庞杂的微生物组中准确识别出感染蝙蝠的病毒，可能极具挑战性。特别是，许多蝙蝠以昆虫为食，也容易感染节肢动物寄生虫，这两者都可能携带病毒，昆虫病毒和噬菌体在蝙蝠宏基因组数据库中都是经常被检测到的。
因此，为了充分利用对蝙蝠病毒的mNGS研究所获得的日益增长的信息，需要开发新的生物信息学工具，以快速且准确地识别那些最有可能感染蝙蝠的病毒。类似地，要决定哪种蝙蝠病毒可能具有引发人类大流行的潜力，单纯依靠计算机分析是不可能的。例如，尽管与SARS-CoV-2（新冠病毒）密切相关，但中型菊头蝠（Rhinolophus affinis）病毒RaTG13无法与人类ACE2受体结合。
参考文献：
Kate Van Brussel and Edward C Holmes，Zoonotic disease and virome diversity in bats，Current Opinion in Virology，Volume 52, February 2022, Pages 192-202，https://doi.org/10.1016/j.coviro.2021.12.008
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