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蝙蝠中的人兽共患病和病毒基因组的多样性（5）
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蝙蝠中的人兽共患病和病毒基因组的多样性（5）
前记：蝙蝠可能是多种人兽共患病的来源，但蝙蝠也是地球生态系统中不可或缺的重要组成部分，而且蝙蝠是目前处于濒危状态需要重点保护的物种。应正确认识新冠病毒、狂犬病毒和其他多种病毒与蝙蝠的关系，应在科学认识和有效控制病毒性传染病的同时，进一步加强对蝙蝠的保护。蝙蝠现在比以往任何时候都更需要我们的保护。
本文通讯作者Edward C Holmes 是国际著名进化生物学家和病毒学家，澳大利亚科学院院士，悉尼大学研究员和教授 ，也是上海复旦大学的荣誉客座教授。本文发表在本月最新出版的国际专业杂志《 Current Opinion in Virology（病毒学时论）》上。本博客将陆续摘要译介此文的内容。
本文的目录：
一）引言
二）蝙蝠的病毒基因组的多样性
三）与蝙蝠有关的值得注意的人兽共患病的暴发
1）冠状病毒科（Coronaviridae）
2）副粘病毒科（Paramyxoviridae）
3）弹状病毒科（Rhabdoviridae）
四）为什么蝙蝠能成为众多病毒的储存宿主?
五）蝙蝠病毒基因组的挑战
六）结论——蝙蝠的未来尚难以预测
三）与蝙蝠有关的值得注意的人兽共患病的暴发
1）冠状病毒科（ii）
2012年，中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)在沙特阿拉伯出现，导致呼吸道疾病和相对较高的死亡率。对单峰骆驼（Dromedary camels）的研究发现了多个MERS-CoV 样谱系(以及α型冠状病毒HCoV-229E)，反映了在这些动物中数十年的流行，并曾多次发生向人类传播和广泛重组的事件。值得注意的是，类似MERS-CoV 的病毒也在伏翼属（Pipistrellus ）和凹脸蝠属（Nycteris ）蝙蝠等多种蝙蝠中被发现。因此，这些蝙蝠病毒很可能是后来通过骆驼出现的中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）的宿主。然而，与MERS-CoV最密切相关的蝙蝠冠状病毒在刺突蛋白上也有显著差异，并降低了与MERS-CoV使用的人二肽基肽酶4细胞受体（human dipeptidyl peptidase 4 cell receptor）的结合能力。
在2019年底,中国武汉首次报告了SARS-CoV-2（新冠病毒）导致的人严重肺炎。宏基因组检测和相关的系统发育分析已经在几个亚洲国家(中国、柬埔寨、泰国、日本和老挝)的菊头蝠属(Rhinolophus）蝙蝠 中发现了与SARS-CoV-2密切相关的病毒。例如，在中国云南省的一个热带植物园进行的两项研究中，从几种菊头蝠属蝙蝠：小菊头蝠（R. pusillus）、小褐菊头蝠（R.stheno）和马来西亚菊头蝠 (R. malayanus）收集的粪便样本中检测到5种与SARS-CoV-2相关的冠状病毒。在同一采样点鉴定出α型冠状病毒－猪疫病病毒（porcine epidemic disease virus）的近亲属。最值得注意的是，最近在老挝的3种菊头蝠属（Rhinolophus）蝙蝠：马来西亚菊头蝠 (R. malayanus）、小菊頭蝠（R. pusillus）和马氏菊头蝠（Rhinolophus marshalli)中发现了5种SARS-CoV-2相关的冠状病毒，其中3种在系统发育树上与人类SARS-CoV-2的位置几乎重合，且具有与SARS-CoV-2序列高度相似的受体结合域，并具有与人类ACE2受体结合的能力。这有力地证明，野生动物中存在具有感染人类能力的病毒，因此具有大流行的风险。在 SARS-CoV-2样谱系的病毒即沙贝病毒（sarbecoviruses )中，基因组重组也很常见，这极大地复杂化了精确重建进化史的尝试，并表明混合感染在蝙蝠和其他哺乳动物物种中很常见。
尽管重点必然集中在人类疾病上，但蝙蝠祖先的冠状病毒也导致了人类以外物种的疾病暴发。例如，2016年，一种新的α型冠状病毒－猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV)导致中国超过2.4万头猪死亡。2013 - 2016年在广东省的马蹄蝠直肠拭子中检测到SADS 相关的冠状病毒。
参考文献：
Kate Van Brussel and Edward C Holmes，Zoonotic disease and virome diversity in bats，Current Opinion in Virology，Volume 52, February 2022, Pages 192-202，https://doi.org/10.1016/j.coviro.2021.12.008
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