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土壤TOP期刊专栏 | SBB微生物研究进展

已有 3116 次阅读 2021-5-28 20:11 |系统分类:科研笔记




    今天微生态汇总了近期土壤微生物领域Top期刊SBB最值得看的10篇文章,为了方便各位小伙伴研读,我们整理了这些文章对应的pdf文档,有需要的小伙伴可以免费领取文献包(限48h)。具体领取方式请参见文末


Soil Biology and Biochemistry

科研| Soil Biology and Biochemistry:亚马逊森林砍伐丰富了抗生素抗性基因

本文由许茜编译

  巴西圣保罗大学农业应用核能中心(CENA)细胞与分子实验室Lucas William Mendes等人于12月13日在Soil Biology and Biochemistry发表题为《Amazon deforestation enriches antibiotic resistance genes》的文章,本研究对亚马逊东部和东南部的48个0-10 cm的土壤样品进行了化学性质分析DNA提取宏基因组测序。另外,使用经过确认的抗生素抗性功能以及RESFAM序列数据库中可用的不同级别功能机制组织精选蛋白家族库筛选抗生素抗性基因(ARGs),并对土壤抗性组结构组成进行了分析。结果表明亚马逊森林砍伐丰富了土壤抗生素抗性基因(ARGs)以及人类干扰如何对微生物群落产生选择性压力以增加土壤抗性

 

摘要:畜牧业生产和农业的扩张增加了亚马逊雨林的森林砍伐率,并对气候以及微观和宏观生物多样性产生影响。尽管已有许多研究评估了森林砍伐对微生物组的影响,但其对土壤抗性的影响仍未知。考虑到抗生素抗性基因(ARGs)对全球健康和食品安全构成威胁,本研究我们对亚马逊地区土地利用变化如何影响土壤抗性组进行了评估。研究分析揭示一些抗生物素抗性机制和基因在原始森林和发生变化的区域是共同起作用的;然而,森林砍伐及随后向其他土地利用系统的转化增加了抗生素抗性基因的多样性和丰富性。抗生素抗性基因(ARGs)的增加与森林砍伐引起的微生物多样性的增加相互关联,同时伴随着土壤化学性质的改变,如PH和铝。研究表明亚马逊森林砍伐丰富了土壤抗生素抗性基因(ARGs)以及人类干扰如何对微生物群落产生选择性压力以增加土壤抗性。还需要做进一步的研究来探究抗生素抗性基因(ARGs)是否可以通过食物链(如农业土壤)转移给人类,危及抗生素治疗效果及公共健康。

关键词:抗生素抗性基因、土地利用变化、宏基因组、微生物生态学、抗性组


原名:Amazon deforestation enriches antibiotic resistance genes

译名:亚马逊森林砍伐丰富了抗生素抗性基因

期刊:Soil Biology and Biochemistry

IF: 5.795

发表时间:2020.12

通讯作者:Lucas William Mendes

通讯作者单位:巴西圣保罗大学农业应用核能中心(CENA)细胞与分子实验室 

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108110

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071720304065





科研| Soil Biology and Biochemistry:非生物和生物因素对泥炭微生物呼吸作用的驱动及其对温度变化的敏感性

本文由葛冉编译 

  法国奥尔良大学Qian Li等人于2020年11月15日在Soil Biology and Biochemistry发表题为《Abiotic and biotic drivers of microbial respiration in peat and its sensitivity to temperature change》的文章。本研究采集了不同地点泥炭地样本并进行室内培养试验,通过对培养试验条件的控制,研究了温度氧气可用率微生物量等对土壤呼吸的影响,并且探究了两种不同降解状态下泥炭分解的温度敏感性。本文的研究结果有助于理解生物非生物因素及其交互作用泥炭土壤呼吸作用中扮演的重要作用。


摘要:由于泥炭地碳储量巨大,因此关注气候变化对泥炭地的影响是十分重要的。在本文中,我们研究了微生物量、温度以及氧气可用率对泥炭藓泥炭地表层及次表层土壤呼吸作用的影响。结果表明,生物和非生物因素间的交互作用能够显著影响土壤的呼吸作用。温度的持续升高增强了微生物的呼吸活性,因此增强了土壤的呼吸作用强度,但温度对呼吸作用的影响存在一个阀值。对于降解程度更高的次表层泥炭地土壤来说,由于溶解性有机碳和微生物量较低,因此二氧化碳产生量也较低,然而次表层土壤的呼吸作用对于温度的敏感性却要高于表层土壤。此外,用于衡量有氧呼吸作用的Q10由表层的1.93±0.26增至次表层的2.20±0.01。在泥炭地最上层50cm深度范围内,Q10与深度所呈现的线性关系可用于改善泥炭地剖面二氧化碳产量估算。

关键词:土壤呼吸、温度敏感性、微生物量、泥炭地


原名:Abiotic and biotic drivers of microbial respiration in peat and its sensitivity to temperature change

译名:非生物和生物因素对泥炭微生物呼吸作用的驱动及其对温度变化的敏感性

期刊:Soil Biology and Biochemistry

IF:5.795

发表时间:2020.11

通讯作者:Qian Li

通讯作者单位:法国奥尔良大学

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108077

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0038071720303734





科研| Soil Biology & Biochemistry:微生物如何能够被用于土壤健康的评估,或者说微生物如何不能用于土壤健康的评估

本文由艾奥里亚编译 

  美国科罗拉多大学博尔德分校的Noah Fierer等人于2020年12月11日在Soil Biology & Biochemistry上在线发表了题为《How microbes can, and cannot, be used to assess soil health》的文章,该研究的目的是通过对可以用来评估监测土壤健康微生物指标进行概述,为它们的合理使用提供指导。虽然目前有关微生物指标仍然缺乏可解释性,但微生物数据可利用性仍具有很大的潜力。基于研究,笔者认为,公司政府非营利组织农民大学在未来有很多的机会以合作的方式以获得更多的微生物数据。这将有助于指导新数据或是和新指标应用解释,同时将有助于减少研究者在基于微生物评估上所浪费的时间金钱

 

摘要:健康的土壤对生态系统、经济和人类的健康来说都至关重要。因此,人们普遍认为,量化土壤健康对于评估和帮助指导管理策略都很重要。但有关土壤健康实际上应该如何衡量目前还不太清楚,特别是考虑到土壤健康不仅仅是土壤物理和化学特性的产物的时候。微生物以及微生物过程作为土壤健康的常用度量标准,其对土壤健康的许多方面都具有公认的重要性。但我们却认为,许多这些预先存在的微生物测量结果并不容易解释或是说不一定能提供有关土壤健康状况的可信推论。本研究中,我们回顾了用于评估或监测土壤健康的微生物指标,并讨论了与其使用相关的一些更广泛的问题。我们提供建议,以更有效地指导和改进如何利用微生物信息来更好的对土壤健康进行评估。


原名:How microbes can, and cannot, be used to assess soil health

译名:微生物如何能够被用于土壤健康的评估,或者说微生物如何不能用于土壤健康的评估

期刊:Soil Biology & Biochemistry

IF:5.795

发表时间:2021.02(2020.12.11 online)

通讯作者:Noah Fierer

通讯作者单位:科罗拉多大学博尔德分校(University of Colorado Boulder)

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108111

原文链接:

https://sci-hub.se/10.1016/j.soilbio.2020.108111





科研| Soil Biology and Biochemistry:土地利用类型、土壤微生物和植物性状对团聚体稳定性的交互作用

本文由杨帆编译

  法国蒙彼利埃大学Luis Merino-Martín等人于2020年12月3日在Soil Biology and Biochemistry发表题为《Interacting effects of land use type, soil microbes and plant traits on aggregate stability》的文章,本研究通过两个试验,试验一,在田间试验中研究土壤土地利用类型植被微生物群落相互作用,试验结果可知团聚体稳定性微生物群落组成之间高度相关试验二,在实验室中不同类型土壤进行接种,结果发现,接种对各种类型土壤的团聚体稳定性的影响相似。本文为今后土壤土地利用类型植被微生物群落相互作用方面的研究提供了研究方法,

 

摘要:土壤团聚体对土壤功能至关重要,但在团聚体的形成中,生物因子所起到作用仍有许多不确定性。了解土壤、土地利用类型、植被和微生物群落的相互作用效应是一项重大挑战,需要在田间和可控的实验室条件,以及在块状和根际土壤中进行评估。为了了解这些效应及其相互作用,我们首先考察了沿土地利用梯度 (古林地、次生林地、草地、牧场和耕地) 的土壤、根系和典型凋落物对微生物群落结构 (大块土壤和根际土壤) 以及团聚体稳定性的影响。然后,我们做了一个接种试验,从耕地和次生林地提取土壤柱,将第三个非结构性壤土作为对照。我们对这三种土壤进行灭菌,使其没有微生物,然后将次生林地和耕地的土壤接种到灭菌后的土壤中。所有土壤类型的对照组均未接种。在完全交叉的设计中,我们种植了两个具有不同根系形态特征的物种: 短枝平台 (纤维系统,有许多细根) 和根荨麻 (主根系统,细根少)。4个月后,测定了微生物群落 (体积土壤和根际土壤) 和团聚体稳定性,以及根系性状。在田间和实验室试验中,通过高通量测序检测细菌 (16S) 和真菌(ITS) 的生物多样性。本实地研究发现:i) 团聚体稳定性和微生物群落组成之间的高度相关性,是受到土地使用的驱动,ii) 土地利用梯度上的团聚体稳定性与细菌群落营养物质之间不显著,但特定的土壤、根和凋落物参数的细菌门水平上,其中贫营养细菌受根际生态位的制约,而共生菌门则更依赖于土壤的整体条件,iii) 土地利用梯度(从林地到耕地),腐生菌和外生菌根真菌的相对丰度降低,其中外生菌根真菌是随着子囊菌群相对丰度的增加而降低,以及担子菌群相对丰度的降低。在实验室的试验中我们发现: i) 将对照组已灭菌土壤中接种田间的土壤,显著提高了土壤的团聚体稳定性,其最初土壤结构不合理, ii) 无论是次生林地还是耕地,接种对团聚体稳定性的影响都是相似的,iii) 这些影响受到根长密度的显著影响。试验结果表明,微生物群落影响土壤结构,细菌群落与根际条件和根系特征 (其中根长密度是最相关的) 密切相关。

关键词:细菌、真菌、球囊霉素、麦角固醇、ITS、根系性状、根系、土壤结构 、16S


原名:Interacting effects of land use type, soil microbes and plant traits on aggregate stability

译名:土地利用类型、土壤微生物和植物性状对团聚体稳定性的交互作用

期刊:Soil Biology and Biochemistry

IF:5.795

发表时间:2020.12.3

通讯作者:Luis Merino-Martín

通讯作者单位:蒙彼利埃大学,法国

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108072

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0038071720303680





科研| SBB:菌根真菌和磷酸酶参与根际磷转化可改善亚热带森林演替过程中的植物营养

本文由李子苹果桃编译

   中国科学院华南植物园生态及环境科学研究中心温达志等人于2020年11月27日在Soil Biology & Biochemistry发表题为《Mycorrhizal fungi and phosphatase involvement in rhizosphere phosphorus transformations improves plant nutrition during subtropical forest succession》的文章。本研究采集了中国南方鼎湖山生物圈保护区3个演替林优势树种叶片根际样品,结合叶片P浓度根际的生物学特性对根际中生物介导磷转化增加植物对P的吸收这一现象进行研究。为热带亚热带地区森林演替期间植物对养分吸收P对植物和微生物的限制、植物根际P含量的变化以及丛枝菌根真菌酸性磷酸酶可在根层中转化P等相关研究提供重要的理论依据。

 

摘要:磷(P)的可用性是热带和亚热带地区植物生长的限制因素,但是许多热带和亚热带森林在磷限制的条件下仍保持较高的生产力和生物多样性,这就是为什么在亚热带森林演替过程中,磷限制和植物群落生物量同时增加的原因。根际中生物介导的磷转化有望增加热带和亚热带地区森林演替期间植物对磷的吸收。本研究采集了中国南方鼎湖山生物圈保护区3个演替林 (早、中、晚) 优势树种的叶片和根际样品,测定了叶片P浓度和根际的生物学特性:微生物生物量P (MBP)、P组分、酸性磷酸酶活性以及丛枝菌根真菌 (AMF) 和外菌根真菌 (EMF) 的生物量。研究发现,从森林演替初期到后期,叶片N:P比值增加,而根际微生物生物量N:P比值下降,这表明森林演替过程中植物磷限制更多,微生物磷限制更少。根际中磷的含量降低与丛枝菌根真菌生物量的增加呈负相关,而不稳定的有机P和中度不稳定的有机P比例的增加与丛枝菌根真菌 (AMF) 生物量的增加呈正相关,但与森林演替过程中酸性磷酸酶活性的增加呈负相关。我们提出了一种基于丛枝菌根真菌 (AMF) 过程的亚热带演替森林中P可用性的机制,该过程增加了被吸附的P向不稳定和中等不稳定的有机P形式的转化,然后是酸性磷酸酶活性将这些可水解的有机P转化为无机P。根际中的磷含量达到植物可利用的磷,将满足森林演替过程中植物对磷的需求增加,从而保持有限磷的热带和亚热带森林的高生产力和生物多样性。

关键词:根际,磷组分,酸性磷酸酶,菌根真菌,森林演替


原名:Mycorrhizal fungi and phosphatase involvement in rhizosphere phosphorus transformations improves plant nutrition during subtropical forest succession

译名:菌根真菌和磷酸酶参与根际磷转化可改善亚热带森林演替过程中的植物营养

期刊:Soil Biology & Biochemistry

IF:5.795

发表时间:2020.11

通讯作者:温达志

通讯作者单位:中国科学院华南植物园生态及环境科学研究中心

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108099

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0038071720303953





科研| Soil Biology and Biochemistry:基质的空间异质性降低了土壤微生物的活性

本文由刘汉文 编译

   瑞典农业科学大学土壤与环境学院Andong Shi等人于2020年10月26日在Soil Biology and Biochemistry发表题为《Substrate spatial heterogeneity reduces soil microbial activity》的文章,本研究通过对可扩散不可扩散两种条件下不同异质程度处理的土壤热耗散率热积累率的测定,研究了基质异质性微生物活性的影响。揭示了基质空间异质性对土壤微生物动力学的影响,强调了将其纳入C循环模型以更好地理解土壤C动力学的重要性。

 

摘要:土壤的异质性影响微生物对底物的获取,并建立底物浓度不同的栖息地,从而导致碳 (C) 动态的局部变化。基于理论推测,我们预计更高的异质性会降低微生物的活性。为了验证这个假设,我们利用具有四个隔间的3d打印圆柱体对基质的空间异质性进行了修改(防止或允许隔间之间的扩散),向每个圆柱体内添加总量相同的葡萄糖(1.5 mg葡萄糖),分别添加一个隔间(局部浓度最高,2.0 mg葡萄糖/g土壤,异质性最高),两个隔间 (1.0 mg葡萄糖- 1个土壤,异质性中等),四个隔间 (局部浓度最低,0.5 mg葡萄糖/g土壤,相当于均匀条件)。因此,我们的实验创造了一个梯度的底物空间异质性。将装有土壤的3D打印圆桶转移到标准量热安瓿中,在18摄氏度下培养超过51小时并在等温量热计中监测土壤热耗散率作为指示土壤微生物活动的指标。当阻止了隔间之间的扩散,尽管局部底物浓度最高,最不均匀的处理显示出了最低的热耗散率。与均匀条件相比,在试验开始时异质性最大的散热率降低了110%,且当热耗散率达到峰值时,异质性最大的处理降低了50%。此外,与匀质处理相比,此峰值的出现延迟了大约2小时。在允许隔间之间扩散的试验条件下基质的空间异质性对微生物活性的影响大大减弱。我们的研究结果揭示了基质空间异质性对土壤微生物动力学的影响,强调了将其纳入C循环模型以更好地理解土壤C动力学的重要性。

关键词:碳循环模型、扩散、散热、尺度转换理论、空间异质性、空间匀质性


原名:Substrate spatial heterogeneity reduces soil microbial activity

译名:基质的空间异质性降低了土壤微生物的活性

期刊:Soil Biology and Biochemistry

IF:5.795

发表时间:2020.10.26

通讯作者:Andong Shi

通讯作者单位:瑞典农业科学大学土壤与环境学院

DOI号:doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.108068

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071720303643





科研| Soil Biology and Biochemistry:氮的添加改变了红树林土壤中微生物群落的组成、多样性和功能:一个培养实验

本文由Sun编译

  英国曼彻斯特大学地球与环境科学学院Hayley Craig等人于2020年11月18日在Soil Biology and Biochemistry发表题为《Nitrogen addition alters composition, diversity, and functioning of microbial communities in mangrove soils: an incubation experiment》的文章,本研究通过采集河口表层10测cm土壤样品进行围隔生态实验,随机分配到四个养分处理(对照、+N、+PK、+NPK) 和两个氧处理 (环境或还原氧培养) 中作为实验处理设计,结合一步PCR高通量测序R语言技术对滨海河口的微生物群落结构进行研究。为微生物生态研究中更好地理解升高的养分对红树林土壤微生物群落的影响,从而有助于更有效地集中管理这些环境。

 

摘要:红树林生态系统由于其高生产力和低分解率,对碳储存非常重要。由于人为活动,水道的营养负荷增加了,目前尚不清楚这将如何影响下游红树林的碳和营养循环,这些红树林接受这些富含营养的水。本研究通过实验室培养实验,评估不同氧条件下,养分添加对红树林土壤细菌群落多样性和结构的影响,以及对土壤微生物群落生物量和活性的影响。利用16S rRNA基因测序鉴定细菌群落多样性和组成,通过测定微生物呼吸和与有机物分解有关的酶活性检测微生物活性。氮的添加导致细菌群落组成发生明显变化,细菌多样性和硫酸盐还原菌丰度下降。在低氧培养条件下,微生物生物量随着氮的添加而降低。细菌群落结构的变化伴随着碳、氮、磷循环中某些酶活性的变化。在还原氧条件下,氮的添加导致微生物代谢商的显著增加,但没有伴随微生物呼吸的变化,这可以解释为微生物生物量的下降。本研究结果表明,氮负荷对红树林环境中的微生物群落和碳和养分循环具有潜在的影响,值得在野外条件下进一步研究。

关键词:红树林、滨海湿地、营养物污染、细菌多样性


原名:Nitrogen addition alters composition, diversity, and functioning of microbial communities in mangrove soils: an incubation experiment

译名:氮的添加改变了红树林土壤中微生物群落的组成、多样性和功能:一个培养实验

期刊:Soil Biology and Biochemistry

IF:5.795

发表时间:2020.11

通讯作者:Hayley Craig

通讯作者单位:英国曼彻斯特大学地球与环境科学学院

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108076

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071720303722





科研| 北京大学:从热带到北方森林土壤的微生物残留模式和影响因素

本文由YQ编译

  北京大学城市与环境学院方精云课题组于2020年10月29日在Soil Biology and Biochemistry发表题为《Patterns and determinants of soil microbial residues from tropical to boreal forests》的研究论文,本研究探究了中国东部及全球森林的土壤微生物分布格局影响因素。从热带到北方森林,土壤微生物残留浓度显著增加,主要受温度和土壤氮的影响。研究微生物残留地理格局和影响因素有助于量化非生物和生物因素在控制土壤中微生物残留中的作用,并有助于在参数化模拟有机碳形成过程中的微生物组成。


摘要:全球气候变化背景下,土壤碳稳态至关重要。研究表明微生物残留是影响土壤碳持续存在的重要因素。而不同环境下的土壤微生物残留模式和影响因素仍缺乏研究。本研究结合中国东部热带到北方森林的实地调查和全球森林生物群落分析,评估生物和非生物因素如何控制土壤微生物残留物的地理格局(以氨基糖表示)。研究发现在中国乃至全球范围内,从热带森林到北方森林,土壤微生物残留浓度显著升高,主要受温度和土壤氮的影响。与细菌相比,真菌更倾向于在高纬度地区积累。然而,所有森林土壤中,土壤碳氮比与总残留碳/有机碳量呈显著负相关,表明热带森林微生物残留碳对有机碳的贡献大于北方森林。研究结果表明从北方森林到热带森林,气候和土壤在微生物介导的土壤碳稳态中发挥着重要作用。

关键词:氨基糖、微生物残留、土壤有机碳、森林、温度、土壤氮素


原名:Patterns and determinants of soil microbial residues from tropical to boreal forests

译名:从热带到北方森林土壤的微生物残留模式和影响因素

期刊:Soil Biology and Biochemistry

IF:5.795

发表时间:2020.10

通讯作者:方精云

通讯作者单位:北京大学城市与环境学院

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108059

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071720303552





科研| Soil Biology and Biochemistry:热带森林中降雨量的长期增加减少了土壤有机磷的分解

本文由小白同学编译

 

摘要:在热带森林生态系统中,降雨量的增加可能会影响土壤磷元素的循环,但控制土壤有机磷转化的生物和非生物因素尚不清楚。本研究通过7年长期田间试验,考察了增加降雨量(+25%)对热带森林土壤中磷元素动态变化的影响。由于土壤有机质和有机铁/铝氧化物有效性有所提高,降雨量的增加提高了森林土壤对磷的最大吸附能力。土壤有机质、金属(Mn、Mg、Ca) 和磷形成了稳定的三元复合物,增加了土壤对有机磷的表面吸附作用。此外,由于慢生根瘤菌等微生物丰度有所减少,土壤中碱性磷酸酶活性也有所降低。研究发现,热带森林雨季降雨的增多抑制了磷酸酶活性,不利于土壤有机磷分解,而强化了土壤对磷的吸附能力。综上所述,长期降雨量增加可以提高土壤中有机磷的吸附和积累,降低其生物有效性,从而抑制了热带森林中植物对磷元素的吸收。

关键词:气候变化、土壤有机磷、线虫群落、热带森林、磷吸收能力

 

原名:Long-term increase in rainfall decreases soil organic phosphorus decomposition in tropical forests

译名:热带森林中降雨量的长期增加减少了土壤有机磷的分解

期刊:Soil Biology and Biochemistry

IF:5.759

发表时间:2020.10.26

通讯作者:彭长连

通讯作者单位:华南师范大学生命科学学院

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108056

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0038071720303527





综述| Soil Biology and Biochemistry:干湿交替节水灌溉对水田土壤Gallionella相关铁氧化菌群落动态的影响

本文由国民少女编译

    名古屋大学生物农业科学研究生院Takeshi Watanabe于2020年11月7日在Soil Biology and Biochemistry期刊上发表题为《Influence of alternate wetting and drying water-saving irrigation practice on the dynamics of Gallionella-related iron-oxidizing bacterial community in paddy field soil》的文章,本文从微生物学土壤科学等多方位的研究将有助于理解与水稻土壤中Gallionella相关的FeOB的潜在作用

 

摘要:铁(Fe)的氧化还原循环是稻田土壤生物地球化学中的关键过程。最近有评论指出,隶属于Gallionellaceae(与Gallionella相关的FeOB)的Fe(II)氧化细菌是土壤中Fe(II)氧化的关键因素之一。本研究旨在调查三个季节(干-湿-湿季节)水稻种植交替节水干湿灌溉对节水水稻种植对稻田土壤中与Gallionella相关的FeOB群落动态的影响。与连续淹水(CF)灌溉相比,交替节水干湿灌溉减少了土壤中的Fe(II)含量,尤其是在旱季水稻种植期的后半段。相反,在交替节水干湿灌溉稻田的水稻栽培期的后半期,观察到了与Gallionella相关的FeOB的16S rRNA基因拷贝数增加的趋势。结果,在Fe(II)含量和16S rRNA基因的拷贝数之间观察到显着的负相关。对与Gallionella相关的FeOB的16S rRNA基因进行PCR-DGGE分析表明,CF和交替节水干湿灌溉水稻土的带型不同。同时,克隆文库分析的结果表明,在CF和交替节水干湿灌溉水稻土上未观察到与Gallionella相关的FeOB的分类学组成差异,这表明Gallionella相关的FeOB在单个菌株水平上对交替节水干湿灌溉有响应。研究场地土壤中Fe(II)氧化活性的潜力及其与Gallionella相关的FeOB的活性对Fe(II)氧化的表观贡献估计为2.4×10-3至1.7×10-1mg。本研究表明,田间湿润和干燥的反复循环引起的铁氧化还原状态的变化,导致了土壤中与Gallionella相关的FeOB的群落结构发生了变化。此外,有人建议与Gallionella相关的FeOB肯定参与了交替节水干湿灌溉稻田土壤中的Fe(II)氧化过程。

关键词:铁氧化细菌、芽孢杆菌、稻田土壤、节水灌溉、PCR-DGGE、qPCR


原名:Influence of alternate wetting and drying water-saving irrigation practice on the dynamics of Gallionella-related iron-oxidizing bacterial community in paddy field soil

译名:干湿交替节水灌溉对水田土壤Gallionella相关铁氧化菌群落动态的影响

期刊:Soil Biology and Biochemistry

IF:5.795

发表时间:2020.11

通讯作者:Takeshi Watanabe

通讯作者单位:名古屋大学

DOI号:10.1016/j.soilbio.2020.108064

原文链接:

https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.108064





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