卢森堡系统生物学研究中心(LCSB)主任Rudi Pulling到所里访问,给我们将来他是如何在四年前白手起家,用政府五年期投资的两亿欧元建立起这个系统生物学研究中心的。卢森堡如何会花这样大的价钱来支持系统生物学研究呢 ?
卢森堡人口只有50万左右,长80公里,宽60公里。小的不能再小,却是世界上最富有的国家。卢森堡是个典型的船小好掉头的例子。1876年,卢森堡到英国学会了炼钢,将炼钢技术精益求精,如今成为全世界最大的炼钢中心。1960年以后钢铁企业成为夕阳产业,卢森堡又大力发展银行业,如今有180家跨国银行,成为全球屈指可数的金融中心。2008年金融危机以后,银行业几近停顿,卢森堡又把银行业挣到的钱大把的投资到InterNet 和生物医学领域。Skype and 亚马逊的欧洲总部都在卢森堡,已经建立起几家非常大的Data Center。而卢森堡系统生物学研究中心,也正是这一方向的大手笔。
Rudi Balling的长项是小鼠脑神经科学,LCSB一开始只有三四个人,七八条枪。他必须为LCSB选择一个可以专精的方向。必须是科研上的处女地,又可以为卢森堡的国民带来看得到的成果。Rudi Pulling最后拍板 --- “帕金森”。4年之间,他建立了三条战线:
计算生物学方面,和日本的大牛Kitano合作,从文献中建立所有与帕金森有关的singaling pathways, 建立帕金森标志性生物分子的动力学数学模型和线粒体的新陈代谢的数学模型。
生物实验方面,建立帕金森的细胞模型和小鼠模型。细胞模型主要是从帕金森病人的iPS细胞定向分化到Neuron和Microglial细胞,结合数学模型研究可能出错的基因和singaling pathways。
临床方面,对30个遗传帕金森的家庭进行全基因组测序 (这是和CGI合作的,先已经被华大基因并购。诸位如果看到华大基因有帕金森的论文上NSC, 也就不用奇怪了),寻求帕金森的治病基因。因为线粒体因帕金森而使新陈代谢发生变化,LCSB正在寻求可以反映这一变化的bioMarker,并且能够在皮肤细胞,直肠细胞和血细胞中通过高通量图像分析可以方便的直接检测到。
有意思的是,RudiBalling建立的所有方向都是“study biology systematically, but NOT study biological systems”。到底什么是系统生物学,现在还是一个仁者见仁,智者见智的问题。
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诺奖得主Sydney Brenner谈系统生物学的研究思路