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陈庚/谢鹭/赵方庆/David P. Kreil 主持专刊 | 测序技术和生物信息学方法在癌症生物学中的应用

已有 1865 次阅读 2021-7-7 17:35 |个人分类:前沿专刊|系统分类:论文交流

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本专刊希望能集中收录一些利用群体细胞测序或单细胞测序技术及生物信息学方法来深入研究癌症方面的文章。主要包括但不限于以下方面:

  • 利用群体细胞测序或单细胞测序技术鉴定与癌症发生、发展、转移等紧密相关的基因;

  • 基于高通量测序数据挖掘与癌症诊断和预后等紧密关联的生物标志物等;

  • 基于测序和相关生物信息方法解析肿瘤的异质性和进化等机制;

  • 开发新生物信息学方法来高效解析各种组学(包括基因组、转录组和表观组等)的肿瘤测序数据;

  • 开发新生物信息学工具来有效整合或注释不同组学测序数据以促进对癌症的理解。

该研究领域的重要性

该专刊的主题为测序和生物信息学在癌症中的研究应用。目前群体细胞(bulk)测序和单细胞(single-cell)测序技术已广泛应用于癌症研究,极大促进了精准医学的发展。虽然通过测序已发现诸多癌症相关的突变、基因和生物学通路等,但还有很多与癌症紧密相关的不同组学层次特征和机制有待发现和阐释。而且,随着测序技术的革新及测序价格的下降,产生的数据量和样本量也越来越大。也亟需开发新的生物信息学方法来更高效地解析高通量测序大数据。因此,各类测序技术和生物信息学在癌症研究中起着非常重要的作用,将不断促进精准医学的发展。

该研究领域的前沿趋势

对于癌症研究方面,目前国内已开始充分利用各类测序技术(包括群体细胞和单细胞测序),从不同组学层次研究癌症的发生、发展和转移等。加速了基础研究的临床转化,促进了癌症的精准诊断、预后和治疗。

肿瘤是非常复杂的疾病,不同组学层面相互关联和影响。因此,群体细胞和单细胞多组学是重要发展趋势,可有效系统地从不同维度解析癌症

征稿信息

该专刊可收录的文章类型主要有:Original Research Articles, Reviews 和 Mini-reviews 等,究内容期望重点与癌症的发生、发展、转移、异质性、进化等方面紧密关联

该专刊不接收描述性研究,也不接收仅仅只利用公共数据来进行分析挖掘的文章,除非能够进一步延伸并深入地从生物学或机制层面解析癌症。

文稿应具有科学性、创新性、实用性,论点明确,资料可靠,文字精炼,层次清楚,数据准确,通过完全公开、公正、严格的同行评审后在线发表。文章一经上线,即可被引用。

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此前沿专刊发布在:

  • Frontiers in Cell and Developmental Biology

    (IF: 6.684 / CiteScore: 2.7)

此专刊仍接受投稿,截稿时间:

  • Abstract - 2021 年 08 月 24 日

  • Manuscript - 2022 年 03 月 20 日

关于更多此前沿专刊的详细信息及投稿方式,请点击链接查看:https://is.gd/wAjLEn



客座主编团队

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陈庚

臻和科技

科研生信总监

谢鹭

上海生物信息技术研究中心

研究员

赵方庆

中国科学院

研究员

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David P. Kreil

Boku University Vienna

教授



客座主编对于前沿专刊模式的看法:

非常好,能够有效地收录一些关于特定topic的文章,对相关重要领域的发展有较好引领和促进作用。


原文内容整理自陈庚博士的文字采访


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