（1）δaδi

       Programming language：C，Python

       Reference：10.1371/journal.pgen.1000695（PLoS Genetics ，2009）

       Manual：https://bitbucket.org/gutenkunstlab/dadi/src/master/doc/user-guide/

       Link：https://bitbucket.org/gutenkunstlab/dadi/src/master/

（2）G-PhoCS

       Programming language：C

       Reference:10.1038/ng.937（Nature Genetics，2011）

       Manual：https://github.com/gphocs-dev/G-PhoCS/blob/master/GPhoCS_Manual.pdf

       Link：

           https://github.com/gphocs-dev/G-PhoCS

           http://compgen.cshl.edu/GPhoCS/

（4）PSMC

       Programming language：C

       Reference: 10.1038/nature10231（ Nature，2011）

       Manual：https://github.com/lh3/psmc

       Link：https://github.com/lh3/psmc

（5）fastsimcoal

      Programming language:—

      Reference:

          10.1093/bioinformatics/btr124(Bioinformatics，2011)

          10.1371/journal.pgen.1003905（PLOS Genetics，2013）

          10.1093/bioinformatics/btab468(Bioinformatics，2021)

      Manual：http://cmpg.unibe.ch/software/fastsimocal2/

      Link：http://cmpg.unibe.ch/software/fastsimocal2/

（6）MCMC

      Programming language：D

      Reference：10.1038/ng.3015（ Nature Genetics，2014）

      Manual：https://github.com/stschiff/msmc

      Link：https://github.com/stschiff/msmc

（7）stairway plot

     Programming language：Java

     Reference: 10.1038/ng.3254（Nature Genetics，2015）

     Manual：https://github.com/kern-lab/stairwayPlotMisorient/blob/master/readme02.txt

     Link：https://github.com/kern-lab/stairwayPlotMisorient

（8）Ima2p

     Programming language：C++

     Reference: 10.1111/1755-0998.12437（Molecular Ecology Resources，2015）

     Manual：https://github.com/arunsethuraman/ima2p/blob/master/IMa2p%20manual.pdf

     Link：

         https://github.com/arunsethuraman/ima2p

         https://bio.cst.temple.edu/~hey/software/ima2p

   (9)TNSFS

      Programming language：——

      Reference: 10.1093/molbev/msv158（Molecular Biology and Evolution，2015）

   (10)SMC++

      Programming language：C++

      Reference: 10.1038/ng.3748（Nature Genetics，2016）

      Manual：https://github.com/popgenmethods/smcpp

      Link：

          https://github.com/popgenmethods/smcpp

          https://hpc.nih.gov/apps/smcpp.html

(11)dadi

     Programming language：——

     Reference: 10.1534/genetics.117.201251（ Genetics ，2017）

     Manual：https://bitbucket.org/gutenkunstlab/dadi/src/master/doc/user-guide/

     Link：https://bitbucket.org/gutenkunstlab/dadi/src/master/

(12)momi2

     Program language：Python

     Reference:10.1080/01621459.2019.1635482（ Journal of the American Statistical Association ，2020）

     Manual：

          https://github.com/popgenmethods/momi2/tree/master/docs

          https://momi2.readthedocs.io/en/latest/tutorial.html

     Link：https://github.com/popgenmethods/momi2