pangxie的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/pangxie

博文

Pan-genome与Core-genome曲线拟合

已有 2642 次阅读 2021-3-22 21:43 |个人分类:computer|系统分类:科研笔记

#“line2P” # y=a*x+b

#“line3P” # y=a*x^2+b*x+c

#“log2P” # y=a*ln(x)+b

#“exp3P” # y=a*exp(b*x)+c

#“power3P” # y=a*x^b+c)

#install.packages("basicTrendline")

#Pan-genome,“power3P”

#Core-genome,"exp3P"

library(basicTrendline)

data1<-read.csv("pan.csv",header = TRUE)

x <- data1$x

y <- data1$y

p1<-trendline(x,y,model="power3P", ePos.x= "top")


data2<-read.csv("Core.csv",header = TRUE)

x <- data2$x

y <- data2$y

p2<-trendline(x,y,model="exp3P", ePos.x= "top")



参考来自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6ac25ea00102yfpc.html







https://blog.sciencenet.cn/blog-3448646-1278095.html

上一篇:相对丰度带来的偏差
下一篇:实验工程菌,无害菌,为什么不能流通在大自然中。
收藏 IP: 185.200.34.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

全部作者的其他最新博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-11-23 21:26

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部