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#控制面板,程序,启用或关闭windows功能,勾选适用于Linux的Windows子系统
#在应用商店,搜索Ubuntu,安装,设置账户与密码
#配制Ubuntu镜像
cd /etc/apt
sudo mv sources.list sources.list.bak
vim sources.list
# 默认注释了源码镜像以提高 apt update 速度,如有需要可自行取消注释
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy main restricted universe multiverse
# deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy-updates main restricted universe multiverse
# deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy-updates main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy-backports main restricted universe multiverse
# deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy-backports main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy-security main restricted universe multiverse
# deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy-security main restricted universe multiverse
# 预发布软件源,不建议启用
# deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy-proposed main restricted universe multiverse
# deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ groovy-proposed main restricted universe multiverse
sudo apt-get update
#安装oh my zsh
sh -c "$(curl -fsSL https://gitee.com/shmhlsy/oh-my-zsh-install.sh/raw/master/install.sh)"
安装 sudo apt install zsh
cd
vim .zshrc
#修改主题“ys”
source .zshrc
# 下载最新版的miniconda3
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
# 运行安装程序
sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
#按安装过程中提示操作:回车查看许可协议,空格翻页,输入yes同意许可;默认安装目录为你的家目录下~/miniconda3目录,可回车确认使用此目录;安装结束时提示是否添加至你的环境变量~/.bashrc,可以选择yes或no。选yes可直接将conda3环境加入环境变量的最高优先级,使用方便,但Python3变为默认环境,破坏你之前依赖Python2的软件环境。而选no不添加保证之前软件安装环境不变,但运行conda及相关程序时,需要运行一条命令临时添加~/conda/bin目录至环境变量,或使用绝对路径。以后想要使用conda,需要运行如下命令将conda临时添加环境变量
export PATH=~/conda/bin:$PATH #如果同意添加环境变量,完成后关闭当前终端,新打开一个终端继续操作才能生效。 #默认安装路径
#不初始化
source miniconda3/bin/activate
conda info --envs
conda init zsh
#配制anaconda镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
cat ~/.condarc
#创建新的环境变量
conda create -n python2 python=2
conda create -n python3 python=3
conda activate
#删除环境变量
conda remove -n python2 --all
rm -rf ~/miniconda3/envs/python2
#下载软件安装列表 wget https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2019.7-py36-linux-conda.yml #创建虚拟环境并安装qiime2防止影响其它已安装软件 conda env create -n qiime2-2019.7 --file qiime2-2019.7-py36-linux-conda.yml #删除软件列表 rm qiime2-2019.7-py36-linux-conda.yml #激活工作环境 conda activate qiime2-2019.7 #检查是否安装成功,弹出帮助程序即成功 qiime --help #关闭工作环境 conda deactivate
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