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批量从转录组数据FKPM文件中拷贝出已知序列的信息

已有 1548 次阅读 2020-8-24 15:52 |个人分类:高通量|系统分类:科研笔记| FKPM

        已知感兴趣基因的序列号,想从储存在FKPM的xlsx文档中将该基因的相关信息拷贝出来,是件简单的事情。但是,当感兴趣的基因有很多的时候,工作量就会很大,重复的机械性copy操作也比较容易出问题,尤其是疲惫的时候。为此,本人利用python程序,写了个小程序,由于程序打包后比较大,所以压缩成几个包,请全部下载后,点击“FKPM_copy.zip.001”进行解压

                                                                            FKPM_copy.zip.001

                                                                            FKPM_copy.zip.002

                                                                            FKPM_copy.zip.003

                                                                            FKPM_copy.zip.004

                                                                            FKPM_copy.zip.005

                                                                            FKPM_copy.zip.006

     使用说明:1. 全部下载后,点击“FKPM_copy.zip.001”进行解压,下载不全或点击其它的压缩包,均不能产生.exe小程序。

                      2. 感兴趣的基因序列号(待查基因序列号)置于一个独立的xlsx格式文档的第一列。

                      3. FKPM需要以xlsx格式文档形式储存(如果是xls格式请转换成xlsx格式),且第一列为序列号。

                      4. 本程序与所有xlsx格式文档放置于同一文件夹下,且最好里面没有子文件夹。

                      5. 本程序适用于win10操作系统。


     致谢:1. python 社区(https://www.python.org/

                 2. Eric Gazoni & Charlie Clark who created and maintaines openpyxl package (https://openpyxl.readthedocs.io/en/stable/).



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