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编译安装samtools
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samtools是生信分析常用的工具之一，通常，可以通过conda一键安装安装。但是，通过conda直接安装的samtools版本过低，在sort步骤总是会出毛病，并且缺少很多功能。所以最新版的samtools就需要手动编译安装，接下来，小编将带领小伙伴们如何在Linux上安装最新版samtools：
wget https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.10/samtools-1.10.tar.bz2
tar -jxvf samtools-1.10.tar.bz2
cd samtools-1.10
#等号后面更改为你想要安装samtools的路径。
./configure --prefix=/where/to/install
make
make install
#将此路径目录添加到PATH中，此时你想要使用samtools，只需要到安装目录下的bin文件夹，就可以使用可执行的samtools文件。
cd /where/to/install/bin
./samtools
#配置环境变量(只对当前用户有效)export PATH=/where/to/install/bin:$PATH >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
#对所有用户有效
export PATH=/where/to/install/bin:$PATH >> /etc/profile
#每次都要输入完全路径实在太麻烦了，我们另改个名字。alias samtools='/where/to/intall/bin/samtools'
到这步开始，直接输入samtools,就可以获得我们想要的了。
微信后台回复“samtools”，可获得最新版samtools安装包~
如果安装过程中遇到任何问题，可以留言或者加群联系我们，一起探讨，小编会第一时间回复的。同时小编也专注于基因组学研究，喜欢数据分析，有意向从事基因组学或喜欢数据分析的朋友欢迎入群。
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