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在神经退行性疾病中发现生物标志物的无偏倚方法
Unbiased Approaches to Biomarker Discovery in Neurodegenerative Disease
发表期刊:Neuron
影响因子:17.173
发表时间:2014.11.05
发表单位:宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院
研究背景:
神经退行性疾病,如阿尔茨海默氏病、帕金森氏症、肌萎缩性侧索硬化症和额颞叶痴呆,目前没有治疗这些疾病的方法。对于这些以大脑为基础的疾病,目前对疾病严重程度的诊断和评估几乎完全依赖于临床检查,但这可能只是疾病状态的一个粗略近似。
因此,生物标志物的开发可以改善患者护理并加速治疗的发现。然而,现有的、经过严格测试的神经退行性疾病生物标志物很少,已转化为临床应用的生物标志物甚至更少。为了找到这些疾病的新的生物标志物,可能需要一种无偏倚的、高通量的筛查方法。
下面以帕金森为例,描述这种方法发现生物标志物的潜在效用:
生物标志物的定义是“客观测量和评估正常生物过程、致病过程或药物反应的指标的特征”。国际上都在努力地开发帕金森氏症(Parkinson’s disease,PD)的生物标志物。现有的PD的生物标志物,可分为三类:(1)生化生物标志物。(2)基于脑成像的生物标志物和(3)基于其他模式的生物标志物。这些标志物中,除了少数生化生物标记物和多巴胺能系统成像,大多数都尚未能在多个组中复证。
现有的筛选方法是基于选标记物方法,即测定特定的蛋白与疾病的关联。然而,这种方法的合理的候选名单几乎已经耗尽。因此。提出了另一种方法——无偏倚筛选技术,即同时筛选许多可能的生物标志物,而不需要对其传递重要生物信息的潜力进行先验假设。
图1 两种不同的生物标志物开发策略
无偏倚方法的建立需要两个条件,首先,潜在有用的生物标记物必须存在于筛选的候选对象池中;其次,必须有快速可靠的方法进行筛选。无偏倚方法的分类如图2所示。在神经退行性生物标志物开发之外的几个领域,如乳腺癌也得到了成功应用。这种方法在AD和PD中得开发结果好坏掺半,然而,一些通过偏倚方法筛选的PD生物标志物候选基因已被成功复制。
图2 无偏倚筛选技术的分类
总结:
神经退行性疾病发病在大脑,不适合取样,现有的临床诊断只是主观的判断。因此,作为与疾病相关的客观指标——生物标志物的开发十分重要。大多数生物标志物的开发都采用候选标记物的方法,除了少数例子,这种方法尚未产生可靠的生物标志物。其中的一种代替方法是在成百上千个候选名单里面无偏倚的筛选,这已在其他领域及PD生物标志物例子中成功应用。
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