• pwd：列出当前目录的完整路径，明确你在哪；

• cd ：跳转到其他目录，两个好用的cd命令，"cd -" 跳回最近一次的目录，"cd .." 退回上一层目录；

• ls：列出当前目录内容，最好加上 -l -rt 参数，会更加清晰，目的是明确目录下都有什么；

• mkdir：创建目录；

• rm：删除文件或者目录；

• mv：重命名文件或者目录；

• cat：打开文本文件，内容输出到屏幕； 

• less -SN：打开文本文件，这个是查看文本文件更合适的方式；

• head -n：查看文件前n行；

• tail -n：查看文件尾n行；

• wc -l：计算文本文件的行数；

• ”|“： 管道操作；

• grep命令；

• awk命令；

• sed命令；

• sort命令；

• du -sh ./: 检查当前目录所占空间大小；

• bc -l：启动Terminal下的计算器，可以在这里进行简单的数学运算，输入"quit"就可以退出；

• chmod：修改文件或者目录权限；

1.Jeffery L. Dangl 和 Paul Schulze-Lefert，他们的文章不仅上传数据规范，而且分析代码可打包下载，是不可多得的优秀学术材料，重现高水平文章结果，对自己的分析、理解能力提高是非常显著的。

2.在Github上有一个ngs-docs的帐号， https://github.com/ngs-docs 里面收录了50多套美国高通量测序的培训课程资料，即有代码、测序数据，又有网页讲解，甚至有线下的现场讲课视频。

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4、安装QIIME2需要网速快，时间很长，42min下载了50M