鼠类的化学通讯是鼠类能释放气味信号或化学信号，传递给另一个个体信息，调节彼此行为或生理适应。化学通讯主要指同种个体之间的通讯行为，借此寻找配偶，识别亲属，建立社会等级，保护领域，协调社群关系，亲子识别等；有时也指异种个体之间的通讯，比如猎物和天敌之间识别，同域分布鼠种之间关系的协调等。

鼠类释放的体外的气味都可能作为化学通讯的信号，尿液是其最为普遍的信号源，还有泪腺，唾液等。鼠类进化出了特有的气味腺体，比如，鼠科的鼠类（如 褐家鼠， 小家鼠等）有包皮腺，成对位于阴茎或阴蒂前方的皮肤和腹肌之间（雌鼠的也称阴蒂腺），两个导管开口于尿道，分泌物伴随尿液标记来传递信息。仓鼠科田鼠亚科也有包皮腺， 比如， 布氏田鼠，棕色田鼠，麝鼠（麝鼠香腺）等。其它兽类也可能有包皮腺，比如麝的麝香腺。仓鼠科仓鼠亚科具有特化的皮脂腺，往往对称位于身体两侧和腹中的皮肤上，表现为明显的“肿块”， 比如大仓鼠的胁腺和腹中腺，长爪沙鼠的腹中腺等，它们往往具有腺体标记行为，将腺体的分泌物标记到物体上传播信息。这些腺体往往随着性成熟呈现明显的性二态，在雄性中发达，明显受到雄性激素的调控。

鼠类释放的气味之所以能够传递物种、家族、个体、性别等信息，都是其中特有的化学组分“编码”的。在同种个体之间这些成分叫做信息素(pheromone),在异种之间叫做异种信息素（allomone）。实验室小白鼠（小家鼠）的信息素研究的最为详细，从雄鼠尿液鉴定出一种双环缩酮类（类似小蠹素）、一种含硫的丁基二氢噻唑、包皮腺分泌的二种金合欢稀、十六醇、十六醇乙酸酯等，具有吸引雌性，表明社会地位，调节雄性之间攻击行为等作用。生理上，雄小鼠尿液的6-羟基-6-甲基-3-庚酮可以调节雌性幼鼠的发育和性成熟；雌鼠过度拥挤产生的2，5-二甲基吡嗪可以抑制雌鼠的动情周期（Lee-Boot效应）。除了这些挥发性化学成分作为信息素， 小鼠和大鼠尿液还含有丰富的主尿液蛋白(MUP), 它既可以束缚挥发性的小分子, 保持信息传递的持久性； 还以作为本能的信息素本身来传递信息，在雄性小鼠中鉴定出了MUP20（Darcin）。大鼠（褐家鼠）的尿液鉴定出2-庚酮，MUP13等雄性信息素。

鼠类有主嗅觉系统和副嗅觉（犁鼻器）嗅觉系统。Linda Buck 和Richard Axel对嗅觉受体的研究获得过2004年诺贝尔奖。 副嗅觉系统是专门接受信息素的，他有V1R和V2R两个受体基因家族。前者主要接受挥发性信息素，比如小鼠2-庚酮的受体是V1Rb2；后者主要接受蛋白类信息素，比如小鼠泪腺信息素ESP1的受体是V2Rp5。特定信息素的受体鉴定的很少。