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《免疫》:吴船团队/赵可吉团队合作阐明新型γ干扰素沉默子对组织稳态的调控

已有 2152 次阅读 2023-4-11 08:18 |个人分类:小柯生命|系统分类:论文交流

2023年4月10日,美国国立卫生研究院、美国国家癌症研究院吴船(NCI, Chuan Wu)实验室和美国国家心肺血液研究所赵可吉(NHLBI, Keji Zhao)实验室合作,在Immunity在线发表题为 Restraint of IFN-γ expression through a distal silencer CNS–28 for tissue homeostasis的最新论文。


文章主要发现一类新的γ干扰素(IFN-γ)基因(Ifng)调控沉默子元件’CNS-28’对机体生理稳态的调控作用。

IFN-γ公认为是哺乳动物体内最重要的细胞因子之一,对调节机体防御,自身免疫反应,抗感染和抗肿瘤都起到十分关键的作用。Th1细胞作为体内主要产生IFN-γ的细胞类型,其调控机制已经被广泛深入的研究。近十几年来,基因组学和表观生物学研究不断发现多个调控r干扰素的保守非编码序列(CNS)作为其增强子元件,对其基因的表达起到正向转录调控作用。然而,对IFN-γ负向调控的沉默子元件从未被找到。

通过对组蛋白H3K4me1在初始CD4 T细胞(naïve CD4 T cell)中Ifng基因修饰的研究,作者发现了之前未认证过的CNS-28序列可以作为Ifng沉默子抑制Ifng基因的转录表达。CNS-28位点上的H3K4me1修饰是通过远端CNS-22上的反式H3K4甲基化修饰而实现的。进一步的机制研究表明,CNS-28元件主要是通过抑制在Ifng基因上的增强子,尤其是增强子CNS-22和启动子的相互作用来实现对IFN-γ表达的限制,并且这种负向调控是不依赖于转录因子T-bet。功能上,作者证明了CNS-28可以在天然免疫和获得免疫反应过程当中,抑制Ifng在Th1、CD8和NK细胞中的转录表达。CNS-28的缺失可以通过失调上升的IFN-γ产生,导致2型免疫反应的下降,最终导致Th1和Th2反应的失衡。

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CNS-28 作为早期染色质重塑的新型远端沉默子,对顺式调控元件在基因调控中起着基础性的作用。此次对CNS-28的鉴定和研究,可以进一步帮助了解顺式元件如何相互合作进行基因沉默,从而严格控制Ifng表达。因此,作者的研究结果提供了关于顺式元件如何相互合作,以达到基因沉默和维持细胞静息状态的思路,揭示了不依赖于T-bet的调控Ifng表达,最终限制过度IFN-γ反应的降低自身免疫性疾病的新机制。这种机制有助于开发传染病和自身免疫的治疗干预措施。

该论文由崔凯荣陈祚迦曹亚强刘帅博士为共同第一作者,吴船教授赵可吉教授为共同通讯作者。





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