xiaokeshengming的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xiaokeshengming

博文

《自然—化学生物学》:方晓峰/林荣呈合作揭示植物感知渗透胁迫新机制

已有 2330 次阅读 2022-11-15 09:22 |个人分类:小柯生命|系统分类:论文交流

北京时间2022年11月15日凌晨0时,清华大学方晓峰团队与中国科学院植物研究所林荣呈团队合作在Nature Chemical Biology上以长文形式发表了题为“Condensation of SEUSS promotes hyperosmotic stress tolerance in Arabidopsis”的研究论文。

5.png

盐碱地和干旱是我国农业生产中重要限制因素,严重威胁我国粮食安全。高盐或干旱条件下植物细胞失水引起渗透胁迫(osmotic stress),造成细胞死亡,抑制植物生长发育。植物细胞通过感知渗透压的变化,在转录、转录后或者翻译水平做出反应,从而降低胁迫带来的损害,但植物细胞感知渗透压的变化的机制尚不清楚。

液-液相分离(Liquid-Liquid phase separation, LLPS)是细胞中生物大分子通过多价相互作用,形成生物大分子聚集体(Biomolecular condensate)的重要机制。蛋白的固有无序区(Intrinsically disordered region)因其氨基酸序列低复杂性,不具有折叠的结构,是介导生物大分子间的多价相互作用的重要方式。生物大分子的LLPS对于细胞内理化环境非常敏感,如温度、pH、离子浓度、拥挤程度等会通过调节LLPS,影响生物大分子凝聚体的组装、解聚或者相转变,为细胞应对外界胁迫提供了新的方式。

清华大学生命学院方晓峰实验室主要研究植物细胞中蛋白质的相分离如何帮助细胞感知、响应和记忆非生物胁迫。研究团队通过筛选发现拟南芥转录调节蛋白SEUSS (SEU)在本氏烟草、酵母和拟南芥中均可以感应渗透胁迫变化并形成蛋白凝聚体(如图1),且这些凝聚体具有液态属性。

4.png

图1. SEU在高渗胁迫下发生相分离形成凝聚体

进一步研究发现,SEU的 N端IDR是其发生相分离的必要且充分条件。高渗胁迫引起细胞失水,细胞体积变小,从而引起细胞内分子拥挤程度和离子浓度升高。SEU的相分离主要由分子拥挤程度升高引发。通过预测发现SEU的IDR1中存在两个α-螺旋结构,通过其构象的改变,感受拥挤程度的变化。α-螺旋的缺失会使IDR1丧失感知分子拥挤的能力,且缺少α-螺旋的SEU蛋白不再能响应渗透胁迫形成凝聚体,因此SEU通过响应细胞内分子拥挤程度的变化,感知渗透胁迫(如图2)。

3.png

图2. SEU的相分离主要感知细胞内分子拥挤程度变化

遗传证据显示,缺失SEU的突变体表现出渗透胁迫敏感表型。中国科学院植物研究所林荣呈课题组主要从事光信号转导与光合作用相关研究。课题组前期发现SEU通过调控生长素合成与信号相关靶基因的表达,进而调控幼苗生长和适应光温环境。有趣的是,不具有响应渗透发生相分离能力的SEU(去除IDR1或者去除IDR1中的α-螺旋结构)能够完全回补其突变体在正常生长条件下的生长发育表型,但不能回补突变体在渗透胁迫下的敏感表型,说明SEU通过其凝聚体正调节植物细胞对高渗胁迫的耐受。通过基因表达分析发现SEU的缺失会使包括P5CS1RD20在内的众多渗透胁迫相关基因的表达在胁迫发生时不能有效表达(如图3)。

2.png

图3. SEU是植物细胞耐受渗透胁迫所必需的

综上,在正常生长状态下SEU在处于均匀分布状态,调控植物生长发育相关基因表达。当植物受到高渗胁迫时SEU利用其IDR1中的两个α-螺旋结构感知细胞内分子拥挤程度的增加,从而引起SEU蛋白的局部浓度升高,触发其相分离。SEU凝聚体可以促进渗透胁迫基因的表达而增强植物的耐逆性(如图4)。本研究揭示了植物感知和应对渗透胁迫的新机制,为研究植物抗逆提供了新思路。

1.png

图4. SEU响应渗透胁迫的工作模式图

清华大学生命学院2020级博士研究生王博宇、博士后张红红以及中国科学院植物研究所副研究员淮俊玲为本文共同第一作者。清华大学生命学院助理教授方晓峰和中国科学院植物研究所研究员林荣呈为共同通讯作者。该工作得到了国家自然科学基金委、清华-北大生命科学联合中心以及中国科学院战略性先导科技专项基金的经费支持。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1038/s41589-022-01196-z

专家点评

赵杨 中国科学院分子植物科学卓越创新中心 研究员

高渗信号是一种物理信号,可以造成植物与酵母细胞多种变化,例如膨压降低、细胞壁完整性破坏、膜张力变化,以及细胞体积下降导致的大分子聚集和相分离等;动物细胞无细胞壁,高渗胁迫主要引起大分子凝聚和相分离。近年来,动物研究发现多价蛋白快速响应渗透介导的细胞体积变化,发生相分离,调控转录终止等过程。植物研究发现FLOE1蛋白响应低渗发生凝聚,参与调控种子萌发;也发现LEA4-5响应大分子聚集信号发生相分离,但是否介导下游响应并不清楚。

清华大学方晓峰老师团队的最新研究发现,转录调节蛋白SEUSS (SEU)可以在体内和体外响应分子拥挤程度信号,发生相分离。其中,IDR1结构域对于信号的感知起核心作用;LDB结构域对信号传导起重要作用。此外,SEU参与调控高渗胁迫下的转录调控,进而影响胁迫下植物的生长。该研究表明,高渗介导的相分离对细胞体积下降信号的感知在动植物中保守,并鉴定到植物渗透信号传导中一个重要的元件,为研究植物渗透响应提供了新的思维。

该工作也引出了多个新的科学问题。首先,除分子拥挤程度信号之外,还有哪些细胞学变化可以作为高渗信号的输入,它们又如何介导胁迫应答?其次,植物与酵母具有细胞壁,那么具有哪些特化的高渗信号,以及如何与分子拥挤程度信号相互调控?再次,多种具有IDR结构的蛋白可以响应高渗发生相分离,包括已发表的核心组分RAFs、SnRK2s以及ABI5等,这些不同的组分如何共同介导大分子聚集信号的感知和传导?



https://blog.sciencenet.cn/blog-3423233-1363790.html

上一篇:《细胞》:古良才团队首次实现重复印刷分辨率达到1微米的高密度DNA芯片
下一篇:《自然—生物医学工程》:白瑞良/刘英超团队合作报道新型AQP4分子磁共振成像技术
收藏 IP: 101.27.218.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

IP: 180.160.16.*   | 璧� 璧� +1 [18]sallyding2011   2012-6-2 21:34
闄堣€佸笀锛�
鎮ㄥソ锛屾垜鎯虫妸citespace 鍜実oogle earth 缁撳悎璧锋潵浣跨敤锛屼絾鏄痗itespace鐣岄潰geographical閫夐」鍗¢噷Wo s to銆€kml锛坓oogle earth锛夛伎need銆€to revise due to source data format change杩欎竴椤规槸鐏版樉锛岃闂鎬庝箞浣跨敤锛熸垜citespace瀹夎鏂囦欢澶归噷娌℃湁kml杩欎釜椤广€�
璋㈣阿
IP: 221.6.32.*   | 璧� 璧� +1 [17]guoshiyun   2012-2-27 11:20
闄堣€佸笀锛屾偍濂斤紝鎴戜娇鐢ㄧ殑鏄痗itespace 3.0.R2 beta鐗堟湰锛屽彲鏄妭鐐瑰悕绉板ぇ灏忚繕鏄笉鑳芥寜姣斾緥鏄剧ず锛屾樉绀哄嚭鏉ョ殑鑺傜偣鍚嶇О鍏ㄦ槸涓€鏍峰ぇ鐨勶紝璇烽棶鑰佸笀杩欎釜搴旇濡備綍璋冭皭鎵嶈兘杈惧埌鑺傜偣鍚嶇О鎸夎妭鐐瑰ぇ灏忔瘮渚嬫樉绀哄憿锛熻阿璋㈡偍鐨勭瓟澶�
鍥炲  锛� Display > Label Font Size: Node: Uniformed/Proportional.
2012-2-27 21:161 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 116.228.249.*   | 璧� 璧� +1 [16]youyoujingyi   2011-9-25 22:24
闈炲父鎰熻阿闄堣€佸笀锛屽彟澶栨垜杩樻兂鍜ㄨ鎮ㄤ竴涓棶棰橈紝姣斿鏈鍏辩幇鍥撅紝涓€鍏�100涓妭鐐瑰乏鍙筹紝浣跨敤鑷姩鑱氱被鍔熻兘寰楀嚭鐨勭粨鏋滄湁鐨勬椂鍊欏緢涓嶅ソ瑙i噴锛屽鏋滀汉宸ョ殑鎸夌収鏈涔嬮棿鐨勭浉浼兼€т笌鍏辩幇鍏崇郴锛屽皢鐩稿叧鐨勬湳璇綊绫伙紝杩欐牱鐢变笉鍚岀殑鏈绫诲埆鍙互寰楀埌涓嶅悓鐨勪富棰橈紝杩欑鏂瑰紡璇嗗埆鍑虹殑涓婚鍙互琚涓烘槸鈥滅儹鐐逛富棰樷€濆悧锛熻繖鏍峰仛涓庤蒋浠惰嚜鍔ㄨ仛绫荤浉姣旓紝鍦ㄧ瀛︽€т笂鏄惁浼氳鏀诲嚮琚川鐤戯紵
鍥炲  锛� 鍚勬湁鍒╁紛銆備汉宸ュ綊绫讳富瑙傛€у線寰€澶己锛屽挨鍏跺闈炴湰涓撲笟鐨勫唴瀹广€�
2011-9-26 08:531 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 222.44.142.*   | 璧� 璧� +1 [15]liling870828   2011-9-16 17:55
闄堣€佸笀锛屾垜鎯虫暀闂偍锛屾暟鎹鏋滄槸浠嶦BSCO鎴朎lsevier涓嬭浇鐨勫彲浠ョ洿鎺ュ甫鍏itespace杞欢杩涜鍒嗘瀽鍚楋紝涓嬭浇鏄敤浠€涔堟牸寮忚繘琛屼笅杞界殑銆傚鏋滀笉鑳斤紝閭d箞鑳介€氳繃鍏朵粬鐨勬柟娉曡兘瑙e喅鍏堕棶棰橈紵
鍥炲  锛� EBSCO娌¤杩囷紝涓嶄簡瑙c€�
Loet Leydesdorff 鍐欎簡涓€鍐欒浆鎹㈢▼搴忥紝浣犱笂浠栫殑缃戦〉鏌ヤ竴鏌ャ€�
2011-9-21 13:131 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 116.228.249.*   | 璧� 璧� +1 [14]youyoujingyi   2011-9-16 11:35
闄堣€佸笀鎮ㄥソ锛屾垜鎯冲挩璇㈡偍鍑犱釜闂锛�1.浣跨敤Citespace杩涜淇℃伅鍙鍖栧垎鏋愶紝鏂囩尞鏍锋湰閲忕殑鏈€灏忓€煎ぇ姒傛槸澶氬皯鍛紵鎴戞兂鍒嗘瀽缁忔祹瀛︿腑涓€涓瓙闂棰嗗煙锛屾悳绱㈠埌鏂囩尞涓�400绡囷紙寮曟枃绌洪棿鍦�10000宸﹀彸锛屾暟閲忓亸灏忥級锛岃繖涓牱鏈ぇ灏忔槸鍚︿細褰卞搷鍒板浘璋辩殑鍑嗙‘鎬э紵2.Citespace涓璓athfinder network scaling鐨勭簿绠€鏂规硶鏄敤鎴峰彲閫夌殑锛屽鏋滄垜涓嶉€夋嫨浣跨敤杩欎釜绮剧畝鍔熻兘锛岄偅涔堣繖绉嶆儏鍐典笅Citespace 鏄氨绠€鍗曠殑鍏呭綋涓€涓皢鏁版嵁涓殑鍏卞紩鍏辩幇鍏崇郴锛堝湪璁惧畾鐨勯槇鍊兼潯浠朵笅锛夊彲瑙嗗寲鐨勫伐鍏凤紙濡傚悓pajek閭f牱灏嗗叡鐜扮煩闃靛彲瑙嗗寲涓虹綉缁滃浘涓€鑸殑鍔熻兘锛夛紝杩樻槸Citespace鍙﹀杩樻湁浜涘叾浠栫殑鍚庡彴鎿嶄綔锛�3.鎴戜笅杞戒簡鏈€鏂扮増鏈殑Citespace 3.0 R1锛屼絾鏄妭鐐瑰悕绉板ぇ灏忔寜姣斾緥鏄剧ず閮ㄥ垎杩樻槸鏈夐棶棰橈紝浠ュ墠灏嗏€渢erm"鍜屸€漚rtical"鍚屾椂閮介€夋嫨鎸夌収棰戞鏄剧ず鑺傜偣灏卞彲浠ユ寜姣斾緥鏄剧ず锛屼絾鐜板湪淇敼杩囧悗鍗存€庝箞寮勯兘鏃犳硶鎸夋瘮渚嬫樉绀轰簡锛屾爣绛鹃兘鏄竴鑸ぇ灏忥紝寰堜笉鏂逛究锛屽笇鏈涙偍鑳芥娊绌烘牳瀹炰竴涓嬨€� 鏈熷緟鑰佸笀鐨勭瓟澶嶏紝闈炲父鎰熻阿鑰佸笀璁捐杩欎箞濂界殑杞欢骞舵棤绉佺殑鍏变韩锛丅EST REGARD!
鍥炲  锛� 1. 鍑嗙‘鎬ф€绘槸鐩稿鐨勩€�
2銆侰iteSpace鏄妸涓€绯诲垪鎸夋椂闂村垝鍒嗙殑缃戠粶缁勫悎璧锋潵鏄剧ず鐨勩€傝繖鏄疌iteSpace鎵€鐙湁鐨勫姛鑳姐€傝繖鏍峰仛鐨勭洰鐨勫弬瑙佹垜2004骞碢NAS鐨勮鏂囥€�
3銆傛寜姣斾緥鏄剧ず杩樺湪锛欴isplay->Label font size: node: uniformed/proportional 鍙互鍒囨崲銆�
2011-9-21 13:081 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 113.140.84.*   | 璧� 璧� +1 [13]閭撲腑鍘�   2011-9-14 12:46
闄堣€佸笀锛屾湰鏉ュ氨鏄�1024锛屾垜鏀规垚512锛岃繕鏄笉琛岋紝浼拌鏄垜鐨勭數鑴戠殑闂銆�
IP: 113.140.84.*   | 璧� 璧� +1 [12]閭撲腑鍘�   2011-9-13 23:43
2G锛屾垜鎯冲簲璇ュ浜嗘妸銆傛€庝箞鏀瑰唴瀛橀銆傗€樹綘鍙牴鎹綘璁$畻鏈轰笂鐨勫疄闄呭唴瀛橀噺鑷繁淇敼launch.jnlp涓�-Xmx1524m銆傝繖閲岀殑1524涓�1524M, 鏃�1.5G. 鈥欒繖鏄粈涔堟剰鎬濋銆傛垜鐨勬槸W7绯荤粺
鍥炲  锛� 鍙傝璇勮[9]銆傜敤notepad鎵撳紑launch.jnlp鏂囦欢锛屾妸-Xxm1524m璇ュ皬鐐瑰効锛�-Xmx1024m.
2011-9-14 00:311 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 113.140.84.*   | 璧� 璧� +1 [11]閭撲腑鍘�   2011-9-10 13:45
灏辨槸鏄剧ず鍦ㄧ櫥闄嗭紝鐧诲綍浜嗕竴浼氬氨娌′簡锛屾偛鍓ч
鍥炲  锛� 鏈哄櫒涓婂唴瀛樹竴鍏辨湁澶氬皯锛�
2011-9-10 23:051 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 113.140.84.*   | 璧� 璧� +1 [10]閭撲腑鍘�   2011-9-9 18:55
闄堣€佸笀锛屽惎鍔ㄦ椂锛屽惎鍔ㄤ竴浼氳嚜宸卞氨鍋滀簡锛屼篃娌℃湁鎻愮ず
鍥炲  锛� Java console閲屾湁浠€涔堟樉绀猴紵鏄惁鏈夎冻澶熷唴瀛橈紵
2011-9-10 07:141 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 182.201.67.*   | 璧� 璧� +1 [9]dluter   2011-8-13 13:23
闄堣€佸笀锛�
鍏充簬鍚姩launch.jnlp鍑虹幇鈥渃ound not create the java virtual machine鈥濈殑闂锛屾垜灏唋aunch.jnlp涓殑-Xmx1524m鏀瑰皬涓€鐐癸紝渚嬪鎴戠殑鏈哄櫒鍐呭瓨鏄�4m锛屾垜灏唋aunch.jnlp涓殑-Xmx1524m淇敼鎴�-Xmx1024m涔嬪悗锛屽氨椤哄埄瑙e喅浜嗐€�
濡傛灉鏈哄櫒鐨勫唴瀛樺皬锛�-Xmx涔熺浉搴旇鏇村皬涓€鐐瑰惂銆�
澶у鍙互璇曡瘯銆�
鍥炲  锛� 濡傛灉鍏抽棴鍏朵粬搴旂敤绋嬪簭锛屼篃鍙互鍦ㄦ洿楂樼殑鍐呭瓨璁剧疆涓嬩娇鐢ㄣ€�
鎴栫潃锛屽紑鏈哄悗鍏堝惎鍔–iteSpace, 鐒跺悗鍐嶅惎鍔ㄥ叾浠栫▼搴忋€�
2011-8-18 22:151 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 168.160.250.*   | 璧� 璧� +1 [8]gunaska   2011-8-11 16:30
濂界殑锛屾垜椹笂鍙互鍙戠粰鎮紝鎮ㄧ殑閭澶氬皯锛�
鍥炲  锛� chaomei.chen@drexel.edu
2011-8-12 01:301 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 168.160.250.*   | 璧� 璧� +1 [7]gunaska   2011-8-5 09:22
闄堣€佸笀锛屾偍濂斤紝鎴戞湁涓棶棰樻兂璇锋暀鎮紝鎴戜滑鍗曚綅鐜板湪璁㈣喘浜咲ialog绯荤粺鏉ヤ娇鐢╯ci鏁版嵁搴擄紝鎴戝浣曟妸瀵煎嚭鐨勬暟鎹斁鍏itespace杩涜鍒嗘瀽锛屾垜鐪嬭蒋浠堕噷浼间箮鏈夎繖涓寜閽紝浣嗘槸涓€鐩存槸鐏拌壊鐨勬棤娉曚娇鐢紝璋㈣阿鎮ㄧ殑绛斿
鍥炲  锛� 鍏朵腑鐨勮浆鎹㈢▼搴忔槸寰堟棭浠ュ墠鍐欑殑锛岃繎鍑犲勾娌℃湁浣跨敤Dialog锛屼篃娌℃湁鍚埌瀵硅繖涓€鏍煎紡鐨勯渶姹傦紝鎵€浠ユ殏涓斿皝瀛樸€�
濡傛灉浣犺兘鎻愪緵灏戦噺Dialog鐨勮緭鍑鸿褰曪紝鎴戞湁鏃堕棿閲嶆柊鎭㈠杩欓」閫夋嫨銆�
2011-8-5 21:051 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 116.112.216.*   | 璧� 璧� +1 [6]xiexg   2011-8-2 08:55
闄堣€佸笀锛屾垜宸插皢鍐呭瓨鏇存柊鑷�2G锛屼絾鏄粛鐒舵棤娉曡繍琛岀▼搴忥紝鏄剧ず鈥渃ound not create the java virtual machine鈥濓紝濡傛灉鎴戝湪鍛戒护閲岃繍琛宩avaws launch.jnlp 锛屾樉绀烘棤娉曞惎鍔ㄨ搴旂敤绋嬪簭銆備及璁″拰鎴戦亣鍒板悓鏍烽棶棰樼殑浜轰笉灏戯紝涔熻璋佹湁杩愯璇ョ▼搴忔垚鍔熺殑浜鸿涓€涓嬭嚜宸辩殑鏂规硶锛岃阿璋�
IP: 221.6.159.*   | 璧� 璧� +1 [5]yangguoli1   2011-7-29 11:01
闄堣€佸笀锛屾垜涓嬭浇濂斤紝瑙e帇缂╁悗锛屽弻鍑烩€渓aunch鈥濇樉绀虹殑鏄€渃ound not create the java virtual machine鈥濓紝浣嗘槸锛屾垜鍙屽嚮瑙e帇缂╂枃浠堕噷鐨�"citespaceII"灏卞彲浠ヤ簡锛屼笉鐭ラ亾杩欐牱浼氫笉浼氬奖鍝嶄娇鐢ㄦ晥鏋溿€�
鍥炲  锛� 杩欐牱CiteSpace鍙敮閰嶇殑鍐呭瓨灏戜竴浜涖€�
2011-7-29 21:531 妤硷紙鍥炲妤间富锛� 璧� 璧� +1 |
IP: 110.19.80.*   | 璧� 璧� +1 [4]xiexg   2011-7-28 23:17
杩愯鍛戒护鎵句笉鍒癹ave-jar锛屾垜鐨勬枃浠跺す鏄叀锛屾垜杩樻槸鐩存帴鍦╠ist涓嬭繍琛孋iteSpaceII.jar绋嬪簭鐪嬬湅缁撴灉鍚с€傝阿璋㈤檲鑰佸笀
IP: 110.17.116.*   | 璧� 璧� +1 [3]xiexg   2011-7-28 21:42
闄堣€佸笀锛屾垜鎹簡涓€鍙扮數鑴戯紝鐩存帴鍦–鐩樹笅寤虹珛鏂囦欢澶筩itespace2,鐒跺悗涓嬭浇瑙e帇锛屼篃鐪嬪埌璇ユ枃浠朵簡锛屾垜鐨勭郴缁熸槸vista,cpu2.4ghz,memory2g,鍙槸杩愯杩樻槸鍑虹幇浜嗕竴涓柊鐨勫璇濇锛屸€滄棤娉曞惎鍔ㄨ搴旂敤绋嬪簭鈥濓紝閮侀椃锛屽緢鎯宠瘯璇曟柊鐗堢殑citespace
IP: 110.17.126.*   | 璧� 璧� +1 [2]xiexg   2011-7-28 18:16
濡傛灉鎴戜笉鍚姩launch.jnlp 锛岃€屾槸鐩存帴杩愯CiteSpaceII.jar鐨勮瘽浼氭槸缁撴灉涓€鑷村悧锛�
IP: 110.17.126.*   | 璧� 璧� +1 [1]xiexg   2011-7-28 18:11
闄堣€佸笀锛屾垜鎸夌収瑕佹眰涓嬭浇瀹夎鍚庡嚭鐜颁竴涓璇濇鈥渃ound not create the java virtual machine鈥濇槸浠€涔堝師鍥狅紝鏄笉鏄垜鐨勮绠楁満鍐呭512MB涓嶅鎵€鑷淬€傝阿璋�

1/1 | 鎬昏:18 | 棣栭〉 | 涓婁竴椤� | 涓嬩竴椤� | 鏈〉 | 璺宠浆

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2025-3-22 09:31

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007-2025 中国科学报社

返回顶部