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《自然—细胞生物学》:刘苹羽/张如刚团队合作揭示RNA编辑蛋白ADAR1调控细胞衰老发生的重要功能和机制

已有 2177 次阅读 2022-7-19 11:29 |个人分类:小柯生命|系统分类:论文交流

北京时间2022年7月18日晚23时,复旦大学人类表型组研究院刘苹羽研团队和美国Wistar研究所张如刚团队,在Nature Cell Biology杂志上合作发表题为“ADAR1 downregulation by autophagy drives senescence independently of RNA editing by enhancing p16INK4a levels”的文章,第一作者为郝雪博士


该研究揭示了自噬介导ADAR1蛋白降解并通过翻译后上调p16促进衰老相关的细胞周期停滞。


细胞衰老是细胞在应对刺激导致其增殖能力不可逆丧失而永久性退出细胞周期的一个过程。细胞衰老主要有两大特征,即细胞周期停滞和衰老相关的分泌表型(Senescence-Associated Secretory Phenotype,简称SASP)。SASP包括促炎症细胞因子、生长因子、趋化因子、细胞外基质金属蛋白酶等复杂成份,介导了衰老细胞对组织微环境的调控,在机体老龄化及衰老相关疾病发生中发挥重要作用 。研究细胞衰老如何发生和SASP如何被调控这一基本科学问题,有助于理解衰老促进老龄化疾病进程的机制,并为靶向细胞衰老促进健康老龄化提供理论基础和潜在策略。


表观转录修饰蛋白RNA编辑酶ADAR1识别由内部重复互补序列形成的双链RNA,催化腺苷(A)脱氨形成肌苷。由于肌苷无法与胸腺嘧啶(T)配对导致双链RNA的二级结构不稳定,从而影响RNA的稳定性、定位、剪切或翻译。目前绝大多数的研究证实ADAR1的生物学功能依赖其酶活性,对于其酶活不依赖的功能和相关机制研究较少。


作者首先在衰老细胞和组织中发现自噬介导ADAR1蛋白降解,抑制细胞自噬可阻止这一过程;在细胞水平敲低ADAR1导致细胞衰老,而过表达ADAR1酶活突变体可阻止衰老发生。同时,全身性敲除Adar1引起小鼠胚胎致死和部分组织(大脑和皮肤)衰老,采用高压尾静脉注射Adar1敲低质粒至小鼠肝脏同样可诱发肝细胞衰老表型。由此表明,ADAR1缺失可诱导细胞衰老发生,而这一过程很可能不依赖于其酶活性。进一步发现,ADAR1缺失降低RNA结合蛋白HuR与SIRT1 mRNA的结合能力,导致SIRT1 mRNA不稳定进而减少其蛋白水平。细胞内低水平的SIRT1不能有效抑制p16 mRNA的翻译, 最终上调p16蛋白导致细胞周期停滞。最后,作者发现老龄化小鼠的大脑、卵巢和小肠等组织中ADAR1表达水平明显低于年轻小鼠,而且ADAR1和SIRT1蛋白水平存在正相关性。


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图:ADAR1缺失促细胞衰老的机制模型


综上所述,该研究揭示了ADAR1缺失导致细胞衰老发生的重要功能,阐明了ADAR1以酶活不依赖的方式调控基因表达的关键机制,丰富了衰老标志物p16的转录后调控机理,并提示ADAR1蛋白水平降低可作为潜在的衰老生物标志物。

      

值得一提的是,2021年刘苹羽博士作为第一作者在NCB发表研究成果证实,m6A甲基转移酶复合物METTL3/14在基因组上重新定位并以不依赖于m6A修饰的方式调控衰老相关分泌表型 (PMID: 33795874)。结合本研究表明,不同的表观转录组修饰在细胞衰老中具有各自的功能和机制。


基于此,刘苹羽研究组将继续研究其它表观转录组修饰调控细胞衰老发生和衰老相关分泌表型的功能和机制,目前实验室处在发展期,诚招博士后,有兴趣者,可以联系pingyu_liu@fudan.edu.cn。


相关论文信息:

DOI:10.1038/s41556-022-00959-z




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