细菌致病因子的表达和植物免疫成分的变化形成了植物与微生物相互作用过程中的复杂关系。

深入研究对这种复杂的互作过程，对全面理解细菌如何引起植物病害以及植物如何保护自己免受病原菌侵染至关重要。

但由于两个主要瓶颈的存在，限制了人们对病原菌如何应答植物免疫反应的探究。

其一是如何从植物宿主细胞内部成功分离出含量极低的细菌RNA。为了克服这一障碍，论文第一作者Tatsuya Nobori博士和王一鸣教授及其同事利用实验室先前建立的病原菌分离方法从植物叶片中富集细菌RNA。

第二，细菌mRNA的水平变化通常不能反映实际的蛋白质表达水平。因此，作者通过同时分析细菌mRNA 和蛋白质的表达来解决这一问题。

为了研究感染期间细菌基因的表达模式，作者选取了模式细菌丁香假单胞菌（Pseudomonas syringae)和拟南芥作为研究材料。

同时，为了解植物免疫对细菌基因表达的影响，作者选取了与植物免疫过程相关的拟南芥突变植株。

细菌转录及蛋白在不同突变体植株中变化的分析表明，受水杨酸(salicylic acid, SA)调控的植物免疫参与了对细菌致病相关mRNA和蛋白质的抑制过程。

值得一提的是，SA介导的植物免疫能够特异地抑制介导病原菌毒性蛋白进入宿主体内的三型分泌系统尖端组分蛋白的累积。

同时，SA途径也能够影响病原菌的趋化性（chemotaxis），但抑制仅发生在蛋白水平，而mRNA水平并无明显变化。

Tsuda教授及其团队获得的大量多组学数据使得他们能够进一步分析病原菌侵入过程中每个细菌基因的表达及调控方式。

通过对4765个基因的表达进行相互关联及聚类分析，研究人员鉴定出许多功能未知的基因簇能够参与细菌生长过程；同时，也帮助作者成功预测出先前未知的转录调控因子，并进一步验证了这些转录因子确实参与了相关基因的表达调控和与病原菌的致病性。

此研究对分析植物与病原细菌互作的过程中，细菌遗传信息如何转化为功能蛋白提供了证据。有助于深入了解植物免疫抑制病原菌侵染的分子机制。

该研究方法还可潜在用于研究包括作物在内的不同植物种类和其他病原菌与共生菌的互作，为优化作物分子育种提供解决方案。

该项目获得华中农业大学高水平人才项目和自主科技创新基金、农业微生物学国家重点实验室、马普学会和德国科学基金会的资助。

目前Tsuda教授团队已有教授2名，博士后2名，博士研究生3名，硕士研究生7名，技术员2名。现大力招收相关专业感兴趣的博士后共同进行科学研究。 

相关论文信息：

https://doi.org/10.1038/s41477-020-0690-7