2月8日，预印本网站medRxiv和bioRxiv更新3篇新冠病毒相关论文，主要内容如下：

注意：预印本网站bioRxiv的所有论文未经同行评议。

medRxiv

结肠上皮细胞的ACE2表达与病毒感染、免疫力和能量代谢有关

由2019新型冠状病毒（2019-nCoV）肺炎引起的呼吸道疾病于2019年12月在中国湖北省武汉市首次出现，并迅速传播到其他省份和其他国家。血管紧张素转换酶2（ACE2）是SARS-CoV的受体，并被认为也是2019-nCoV的受体。矛盾的是，肺中ACE2的表达通过减弱肾素-血管紧张素系统而保护小鼠免受SARS-CoV刺突蛋白诱导的肺损伤；在肠中，ACE2还通过维持氨基酸稳态、抗菌肽的表达和肠道微生物组的生态来抑制肠炎症。

通过分析来自对照受试者和患有结肠炎或炎性肠病（IBD）受试者的单细胞RNA测序数据，广州医科大学的研究人员发现结肠细胞中ACE2的表达与调节病毒感染、先天和细胞免疫的基因呈正相关，但呈负相关具有病毒转录、蛋白质翻译、体液免疫、吞噬作用和补体激活。总之，研究人员认为ACE2在介导2019-nCoV感染的易感性和免疫性中可能起双重作用。

作者：Jun Wang, Shanmeizi Zhao, Ming Liu, Zhiyao Zhao, Yiping Xu, Ping Wang, Meng Lin, Yanhui Xu, Bing Huang, Xiaoyu Zuo, Zhanghua Chen, Fan Bai, Jun Cui, Andrew M Lew, Jincun Zhao, Yan Zhang, Haibin Luo, Yuxia Zhang

相关论文信息：ACE2 expression by colonic epithelial cells is associated with viral infection, immunity and energy metabolism

DOI: 10.1101/2020.02.05.20020545

非洲国家应为新冠病毒的传播做好准备

新型冠状病毒（2019-nCoV）流行已从中国扩散到23个国家。病例输入后，已有7个国家发生了本地传播。没有非洲国家报告过病例。2019-nCoV输入的管理和控制在很大程度上取决于一个国家的公共卫生能力。

法国国家健康与医学研究院等机构等机构的研究人员评估了非洲国家针对其2019-nCoV输入风险的防范和脆弱性。

研究人员使用了从中国感染省份的机场出发并飞往非洲的航空旅行量的数据来估计每个国家引入的风险。研究人员用两个指标确定了国家发现和应对病例的能力：世卫组织《国际卫生条例监测和评估框架》定义的准备情况，以及传染病脆弱性指数定义的脆弱性。根据中国地区对风险的贡献最大，将国家分组。

调查结果表明，进口风险最高的国家（埃及、阿尔及利亚、南非共和国）对疫情爆发具有中等至高能力。处于中等风险的国家（尼日利亚、埃塞俄比亚、苏丹、安哥拉、坦桑尼亚、加纳、肯尼亚）有不等的能力，脆弱性高。研究人员确定了三类国家，它们分别承受来自广东、福建和北京等地区的相同风险。

因此，非洲的一些国家正在加紧准备，以发现并应对2019-nCoV的输入。资源和强化监控应优先在中等风险国家中考虑，这些国家可能不足以应对病毒的输入和限制其继续传播。

作者：Marius Gilbert, Giulia Pullano, Francesco Pinotti, Eugenio Valdano, Chiara Poletto, Pierre-Yves Boelle, Eric D'Ortenzio, Yazdan Yazdanpanah, Serge Paul Eholie, Mathias Altmann, Bernardo Gutierrez, Moritz U. G. Kraemer, Vittoria Colizza

相关论文信息：Preparedness and vulnerability of African countries against introductions of 2019-nCoV

DOI: 10.1101/2020.02.05.20020792

bioRxiv

研究人员开发冠状病毒数据库

最近暴发的一种新型动物来源冠状病毒为潜在的流行性冠状病毒跨物种传播敲响了警钟。

目前迫切需要协助控制冠状病毒传播并提供有价值的科学信息，重庆大学等机构的研究人员开发了冠状病毒数据库（CoVdb），一个在线基因组学和蛋白质组学分析平台。

根据公开访问的冠状病毒基因组信息，该数据库注释了每个菌株的基因组，并鉴定了Genebank中所有可用菌株中780个可能的ORF。

此外，CoVdb还对冠状病毒菌株的所有已发布基因组进行了全面评估，包括历史和全球范围内的种群遗传学分析、功能分析和结构分析。

在该数据库中，研究人员可以轻松地获得冠状病毒基因的基本信息，包括该基因在菌株之间的分布、保守或高突变区域、基因可能的亚细胞位置和拓扑结构。

此外，也提供了用于人口遗传学分析结果的滑动窗口，从而促进了基因组水平的遗传学和进化分析。可以从http://covdb.popgenetics.net免费访问CoVdb。

作者：Zhenglin Zhu, Kaiwen Meng, Geng Meng

相关论文信息：A database resource for Genome-wide dynamics analysis of Coronaviruses on a historical and global scale

DOI: 10.1101/2020.02.05.920009