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本文主要参考了微信公众号“生信宝典”的文章,链接为https://mp.weixin.qq.com/s/I9YboydSHsuVs6hDJSy0vg
首先是数据的准备,你获得一条条的DNA序列,将这些DNA序列放入到excel表中,另存为csv文件,然后读入到R中,数据格式如下:
#需要安装和载入“ggseqlogo”包
install.packages("ggseqlogo")
library(ggseqlogo)
#读取文件"gene_sequence.csv"
gene_sequence=read.csv('gene_sequence.csv',row.names=1)
#将读取的csv文件的gene这一列提取出来,并将其转换为矢量数据
gene_vector=as.vector(gene_sequence$gene)
#出图
ggseqlogo(gene_vector)
这样就获得如下的序列分析图
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GMT+8, 2024-12-26 21:34
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