在太湖平原水环境治理的过程中，有的地方也尝试使用排污权交易这一工具。不过平心而论，有关方面之所以如此，也许更多地是出于一种新鲜感，而不是来自对排污权有了深刻的认识后采取的行动。说外行在那里凑热闹，也许更为贴切。

水体的排污权交易很难。首先难在企业污水排放的异质性。即便同样的COD，此COD与彼COD也是不一样的。能否交易，总应该经过论证或评估吧。即使这一关通过了，后面还有更麻烦的事。比如上下游两个企业间交易，无论排污权是下游流向上游，还是上游流向下游；也无论排污权是从环境质量差的地区流向环境质量好的地区，还是反之，恐怕都会面临许多质疑：为什么这样做是可以的。论证来论证去，交易的成本会高昂到令人惊讶的地步。

另一个问题是水体排污权交易通常数量不大。但每一笔交易涉及的技术环节则不会因为数量小而减少。各种检测、核实、事后监管等，都是需要投入的。于是，数量越小，成本越大，以至于其效率还不如命令控制系统。这也是水体排污权交易难以推广的最根本原因。