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Data-independent acquisition(DIA)是一种基于质谱的蛋白质组学策略,已被用于鉴定和定量蛋白质的翻译后修饰(PTM),如乙酰化[1]。DIA实现了对蛋白质和PTM的深度覆盖和准确定量,使其成为蛋白质组学研究的关键任务之一[1]。DIA方法可以检测PTM、位点定位和谱库[1]。DIA蛋白质组学分析具有广泛的蛋白质覆盖、高度的重复性和准确性[2]。DIA技术已越来越多地应用于各种蛋白质组学研究,包括药物代谢酶和转运蛋白的定量[3]。DIA与样品处理和计算数据分析等其他技术的结合可能会进一步提高测定性能[1]。然而,DIA方法在糖基化等PTM方面仍处于早期开发阶段[4]。
将DIA与乙酰化修饰蛋白质组学相结合,可以利用DIA技术对蛋白质样本进行全面的扫描,从而鉴定和定量乙酰化修饰。DIA方法通过覆盖整个质谱范围,可获得准确的质谱数据,进而确定蛋白质中的乙酰化修饰位置和丰度水平。DIA技术在乙酰化修饰蛋白质组学研究中的应用有助于理解乙酰化修饰在细胞功能和疾病发生发展中的作用机制。此外,结合DIA技术与其他样品处理和数据分析方法,可以进一步提高乙酰化修饰蛋白质组学研究的准确性和可重复性。
然而,需要注意的是,DIA方法在一些PTM方面仍处于早期开发阶段,如糖基化。随着技术的进一步发展和改进,预计DIA方法在乙酰化修饰蛋白质组学研究中的应用将继续增加,并为我们揭示乙酰化修饰在细胞过程和疾病中的重要功能提供更多见解。
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