长链非编码rna (lncRNA)已被证实在许多疾病中发挥重要作用，包括食管鳞状细胞癌(ESCC)。 最近的研究报道了一些lncRNA编码功能性微肽。然而，ESCC与lncRNA编码的微肽之间的关系尚不清楚。在该文章中，研究人员鉴定了一个y -连锁lncRNA, LINC00278，它在男性ESCC中下调。LINC00278编码一种阴阳1(YY1)结合微肽，命名为YY1BM。YY1BM参与了ESCC的进展，抑制了YY1与雄激素受体(AR)的相互作用，而雄激素受体(AR)相互作用减弱通过AR信号通路表达eEF2K。YY1BM下调可显著上调eEF2K表达，抑制细胞凋亡，使ESCC细胞更适应营养剥夺。吸烟减少了LINC00278和YY1BM翻译的变形。总之，这些结果提供了一个新的机制联系吸烟和AR信号之间的男性ESCC进展。本文发表在《Cancer Research》，第一作者是苏州大学科研人员，本文质谱部分由Aimsscientific公司协助完成。

图1

其中通过质谱实验手段发现了LINC00278-sORF1的互作蛋白.

为了确定LINC00278-sORF1在ESCC进展中的作用，文中科学家首先在TE-1和KYSE-30细胞中通过共免疫沉淀和质谱分析研究了LINC00278-sORF1相互作用蛋白。 在TE-1和KYSE-30细胞中，他们寻找可以用LINC00278-sORF1-FLAG融合蛋白而不是IgG免疫沉淀的蛋白。如图A所示，我们确定YY1为潜在的LINC00278-sORF1结合蛋白。随后验证了YY1可以通过LINC00278-sORF1-FLAG融合蛋白免疫沉淀(图B)。此外，他们将YY1-HA和LINC00278-sORF1-FLAG共转染到TE-1细胞中，并使用anti-HA进行共免疫沉淀。Western blot分析显示yy1 - ha和LINC00278-sORF1-FLAG蛋白有免疫沉淀(图B)。最后，我们发现TE-1细胞内源性的LINC00278-sORF1可以使用anti-YY1抗体免疫沉淀(图B)。我们的结论是，LINC00278-sORF1结合YY1和我们将该微肽命名为YY1BM。YY1是一种普遍存在的多功能转录因子，在肿瘤发生过程中起调节作用，包括ESCC。YY1截断实验表明YY1BM与YY1 Cterminal结构域(331-414氨基酸)结合，其中有文献记载与AR结合(图C)。考虑到YY1在前列腺癌中是AR的转录共激活因子，我们检测在ESCC中是否也是如此(图D)。最后，我们发现在TE-1和KYSE-30细胞系中，过表达LINC00278可以下调YY1和AR的相互作用，敲除YY1BM则可以上调YY1和AR的相互作用(图E)。所有的数据表明YY1BM阻断了YY1与AR的相互作用。

图2

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原文链接

蛋白互作质谱