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Plant Cell 发表了N素信号转导的综述预浏览文章

已有 2972 次阅读 2020-3-14 15:43 |系统分类:论文交流

Plant Cell 发表了N素信号转导的综述预浏览文章,预计2020年4月发表。

氮素是植物生长的必需大量元素之一,其中硝态氮是植物主要利用的氮素形态。除了提高氮素利用效率具有重要的农业生产价值以外,N还是一种重要的信号转到物质。作者从生物化学、分子遗传学、基因组学和系统生物学角度阐述了植物利用氮素及氮素信号转导(包括局部信号转导和系统信号转导)的进展。

非常重要:paramount importance 在目前的。。。情况下:in the current scenario

重要的论述如下:

1. 参与N信号转导的重要转录因子

 image.png

作者利用了基因表达调控网络中的度量“边”来衡量了这些转录因子在氮素信号转导过程中的作用,共包括三个信号转导网络,“氮素信号转导总网络”“氮素转运网络”“氮素还原网络”“氮素吸收网络”,从这些转录因子调控的靶基因数来看,最重要的转录因子是TGA1,边数是38,也就是该转录因子调控了38个靶基因,其中9个靶基因参与氮素转运,5个靶基因参与了氮素的还原,24个靶基因参与了氮素同化。

2.不同物种当中参与调控氮素利用效率的基因及功能

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3.作者以年为单位展示了70年不同研究手段发表的N素信号转导的文章的研究主题

 image.png

 

从这个中可以看出对N信号转导的研究主要集中在了基因组水平和分子遗传水平。2010年左右是一个研究高峰。

4.氮素信号转导途径解读

 image.png

2. N素信号转导途径的解读

 

NRT1.1是氮素的转运体,受到三个激酶的磷酸化来调控其对硝态氮(CIPK23, CBL1/9, and ABI2 )的亲和性。 氮素进入细胞后激活PLC活性,从而增加了钙离子的浓度。然后钙离子的信号途径被 subgroup III CPKs 激酶识别,然后继续向下传递磷酸化转录因子NLP7,磷酸化的NLP7可以增加在细胞核中的保留时间,同时启动响应硝态氮的基因表达。于此同时 NLP7与 NLP6, TCP20 and NRG2 相互作用激活硝态氮代谢的基因。NRT2.1是另外一个nitrate sensor.一些列的转录因子在下游的信号转导过程中发挥作用来调控响应硝态氮的基因表达,部分转录因子还可以同时整合磷素信号 (HRS1, HHO1 and PHR1)。

 

5.氮素信号转导的基因表达调控网络

image.png

作者构建了氮素信号转导网络图,按照转录因子的作用大小分为了四个层级。在这个网络中,绿色五角星代表转录因子,五角星大小代表转录因子调控的靶基因的多少,蓝色原点代表靶基因。红边的转录因子代表这些转录因子的表达本身受硝态氮的诱导。转录因子与靶基因之间连线的颜色代表了发现他们之间调控关系的方法。

Blue edges: Chromatin immunoprecipitation (ChIP) binding data. Orange edges: TARGET and Yeast one hybrid data. Red edges: in planta TFregulation and chromatin accessibility . The pink

border of the pentagon denotes TF regulated in response to nitrate.

 

两个常用词汇的纯正英文表达:

非常重要:paramount importance 在目前的。。。情况下:in the current scenario of




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