长链非编码RNA（lncRNAs）是一种长度至少200nt的非蛋白编码的转录本。在调控植物基因表达，尤其是逆境胁迫的响应过程中发挥了极为重要的作用。作者通过挖掘现有的大豆转录组数据分析了不同条件下332个样本中的lncRNAs，共鉴定到了约69000个lncRNAs。lncRNAs在长度、外显子数目、转座子及序列保守性上有其独特性。作者鉴定了一些在逆境条件下tissue-specific and time-specific 特异性表达的lncRNAs，这些lncRNAs可能在植物响应逆境胁迫过程中发挥重要作用。lncRNAs与蛋白编码基因相近，可能与其共转录，尤其是那些反义和内含子lncRNAs. 最重要的结果在于这些lncRNA编码了部分肽分子，这是近年来发现的一类新的信号传递分子，作者的研究确定了这些具有重要信号转导功能的肽分子的来源。

作者利用GO分析对这些lncRNAs的功能进行了研究，从上图可以看出反义lncRNAs的靶基因在2个叶绿体结构中及叶绿体基质和叶绿体envelope中被富集，说明lncRNAs对叶绿体功能具有潜在的调控意义。另外，2类lncRNAs还对转录因子、激酶等诸多重要的逆境相应基因具有调控作用。